RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496466.1

UBXN11-216, Transcript of UBX domain protein 11, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN11, Length 2,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11-216ENST00000496466 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 C1orf112Q9NSG2 853 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 PASKQ96RG2 1323 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ATG7O95352 703 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 SCP2P22307 547 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 CLDN10P78369 228 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 SULF1Q8IWU6 871 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 OTUD5Q96G74 571 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 FAM81BQ96LP2 452 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 TRIM7Q9C029 511 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 LOC285556D6RIA3 1793 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 OATP04181 439 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 LIG4P49917 911 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 WNT7BP56706 349 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 PSMD6Q15008 389 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 LLGL1Q15334 1064 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 QPCTQ16769 361 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 MROH7Q68CQ1 1323 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 C6orf89Q6UWU4 347 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 MOB2Q70IA6 237 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 MDM1Q8TC05 714 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 CPA5Q8WXQ8 436 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 SPATC1LQ9H0A9 340 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 KIAA1586Q9HCI6 787 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 PTPRFP10586 1907 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 TLDC2A0PJX2 215 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 H0YCG3 227 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ECEL1O95672 775 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 HLA-DRAP01903 254 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 RARGP13631 454 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 SLMAPQ14BN4 828 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ZACNQ401N2 412 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ICE2Q659A1 982 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ZNF677Q86XU0 584 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ASAP3Q8TDY4 903 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 AZI2Q9H6S1 392 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 C5orf60A6NFR6 353 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 RIPK2O43353 540 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 FGFR4P22455 802 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 RRM1P23921 792 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 IFT88Q13099 833 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 SGO2Q562F6 1265 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 WDR44Q5JSH3 913 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 EEPD1Q7L9B9 569 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 SLCO2A1Q92959 643 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 CENPTQ96BT3 561 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 TMEM109Q9BVC6 243 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 PLVAPQ9BX97 442 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 RNF181Q9P0P0 153 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 FBXO40Q9UH90 709 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 SBF1O95248 1867 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 MYBL1P10243 752 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 TNNI1P19237 187 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ABCD1P33897 745 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 CDR1P51861 262 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ADCY2Q08462 1091 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 PPP1R7Q15435 360 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 C6orf118Q5T5N4 469 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 LLGL2Q6P1M3 1020 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 KAT2BQ92831 832 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 FNBP1Q96RU3 617 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 PCYT2Q99447 389 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 FAM129AQ9BZQ8 928 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 STYXL1Q9Y6J8 313 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 OTOFQ9HC10 1997 aa15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 SMIM23A6NLE4 172 aa15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 VNN1O95497 513 aa15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 GLRA2P23416 452 aa15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 MMP13P45452 471 aa15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ACOT2P49753 483 aa15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 BPIFB4P59827 614 aa15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 SNX1Q13596 522 aa15.92■□□□□ 0.14
UBXN11-216ENST00000496466 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms