RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 KBTBD6Q86V97 674 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 C4orf19Q8IY42 314 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TCEAL3Q969E4 200 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 GPR88Q9GZN0 384 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 NOTCH4Q99466 2003 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 A0A1B0GUA9 196 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 H7C4K7 107 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PTGESO14684 152 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 GIPC1O14908 333 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 B4GALT5O43286 388 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 DGAT1O75907 488 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 RHOBTB1O94844 696 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CAVIN2O95810 425 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CEACAM1P13688 526 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 ATF2P15336 505 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CYP3A7P24462 503 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 RDXP35241 583 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 SOX9P48436 509 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CYP4A11Q02928 519 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CREB5Q02930 508 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CAPSQ13938 189 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PON2Q15165 354 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 NECTIN1Q15223 517 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PTPAQ15257 358 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 AMHR2Q16671 573 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TPH2Q8IWU9 490 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 GATA6Q92908 595 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 FAM20AQ96MK3 541 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 UROC1Q96N76 676 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 SNTG2Q9NY99 539 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 LAMA1P25391 3075 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TAF4O00268 1085 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 ARNTLO00327 626 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TBX3O15119 743 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 EXTL3O43909 919 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 SEC24BO95487 1268 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CPB1P15086 417 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 GJA1P17302 382 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 LIG1P18858 919 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 GLRA2P23416 452 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 GBP1P32455 592 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CCR2P41597 374 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CLCNKBP51801 687 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PLCB2Q00722 1185 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TWF1Q12792 350 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PLD1Q13393 1074 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CCINQ13939 588 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 EPHA7Q15375 998 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TEAD2Q15562 447 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 PLK5Q496M5 336 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 TPGS2Q68CL5 300 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1-205ENST00000495350 ZNF280DQ6N043 979 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms