RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	WNT8B	Q93098	351 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	DEF6	Q9H4E7	631 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PTPRJ	Q12913	1337 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	FAM163B	P0C2L3	166 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	FGFR4	P22455	802 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	KCNA4	P22459	653 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	WNT7B	P56706	349 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	DSC3	Q14574	896 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	LPIN1	Q14693	890 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF677	Q86XU0	584 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CEP120	Q8N960	986 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	BEST2	Q8NFU1	509 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PGBD4	Q96DM1	585 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CHP1	Q99653	195 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	GPR88	Q9GZN0	384 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PADI3	Q9ULW8	664 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218		A0A0U1RQF3	1178 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	INPPL1	O15357	1258 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	AKR1B10	O60218	316 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	EVI5	O60447	810 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	OFD1	O75665	1012 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	RECQL4	O94761	1208 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CTSH	P09668	335 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PNPLA4	P41247	253 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	KIF11	P52732	1056 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	OSTN	P61366	133 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	MYO1E	Q12965	1108 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CUL2	Q13617	745 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	SLC18A3	Q16572	532 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	JADE1	Q6IE81	842 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM192	Q8IY95	271 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CXorf38	Q8TB03	319 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	APBB2	Q92870	758 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	SNTG2	Q9NY99	539 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	INTU	Q9ULD6	942 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	IPP	Q9Y573	584 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CENPF	P49454	3210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CAPN15	O75808	1086 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	EOMES	O95936	686 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	NFIC	P08651	508 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	GHR	P10912	638 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ITGA4	P13612	1032 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CLCN1	P35523	988 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	APBA1	Q02410	837 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF699	Q32M78	642 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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