RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 B4GALT5O43286 388 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 B4GALT4O60513 344 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 MMEP08473 750 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CLTAP09496 248 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 INSRRP14616 1297 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 COL9A1P20849 921 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 AZI2Q9H6S1 392 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 GLI1P08151 1106 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 CFHP08603 1231 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 MARK3P27448 753 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MAPK4P31152 587 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 MARCKSL1P49006 195 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 NOMO3P69849 1222 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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PTPRC-210ENST00000462363 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MREGQ8N565 214 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RNF149Q8NC42 400 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 AFG1LQ8WV93 481 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 KAT2BQ92831 832 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GLG1Q92896 1179 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CAVIN3Q969G5 261 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 BICD1Q96G01 975 aa6.06□□□□□ -1.44
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