RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 REXO1L1PQ8IX06 675 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 OR5B17Q8NGF7 314 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 CAGE1Q8TC20 777 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 DESI2Q9BSY9 194 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 GPR88Q9GZN0 384 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 UNC93B1Q9H1C4 597 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 HAUS4Q9H6D7 363 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 MYO1AQ9UBC5 1043 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 ITGA11Q9UKX5 1188 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 OGDHLQ9ULD0 1010 aa13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 USP27XA6NNY8 438 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 LACTBL1A8MY62 500 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 KRT86O43790 486 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 P4HA1P13674 534 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 RAB27AP51159 221 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 VAV2P52735 878 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 BPIFB4P59827 614 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 OSTNP61366 133 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 SLC10A6Q3KNW5 377 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 KIAA1328Q86T90 577 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 EFCAB13Q8IY85 973 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 FAM71AQ8IYT1 594 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 ACRBPQ8NEB7 543 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 SNX27Q96L92 541 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 TRAIPQ9BWF2 469 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 CNTN3Q9P232 1028 aa13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 CHRNA1P02708 482 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 CTSHP09668 335 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 SKIP12755 728 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 CCL5P13501 91 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 ARID5AQ03989 594 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 PTK2Q05397 1052 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 PAK2Q13177 524 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 CUL2Q13617 745 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 ZNF699Q32M78 642 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 JADE1Q6IE81 842 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 TMEM192Q8IY95 271 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 TTC39CQ8N584 583 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 KREMEN1Q96MU8 473 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 NIF3L1Q9GZT8 377 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.85□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 KIF5CO60282 957 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 LRRN2O75325 713 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 RECQL4O94761 1208 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 NFICP08651 508 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 TNNT1P13805 278 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 PDE6CP51160 858 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 KIF5AQ12840 1032 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 UBXN11Q5T124 520 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 ZNF677Q86XU0 584 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 BEST2Q8NFU1 509 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 WNT8BQ93098 351 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 KIF12Q96FN5 646 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 DEFB118Q96PH6 123 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 RNF208Q9H0X6 261 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 ERVK-5Q9HDB9 667 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 SNTG2Q9NY99 539 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 INTUQ9ULD6 942 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa13.84□□□□□ -0.19
NISCH-203ENST00000460759 TLR3O15455 904 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 PJA2O43164 708 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 CLSTN1O94985 981 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 CD4P01730 458 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 KCNE1P15382 129 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 CYP3A5P20815 502 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 MAGEA1P43355 309 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 CDK7P50613 346 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 ETF1P62495 437 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 RBP5P82980 135 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 BFSP2Q13515 415 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 XKR4Q5GH76 650 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 ALKAL1Q6UXT8 129 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 C1orf127Q8N9H9 656 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 TATDN2Q93075 761 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 PI4K2AQ9BTU6 479 aa13.83□□□□□ -0.2
NISCH-203ENST00000460759 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms