RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-202ENST00000444658 TTC39CQ8N584 583 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF592Q92610 1267 aa9.95□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-202ENST00000444658 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.93□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 ISCUQ9H1K1 167 aa9.93□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNTN3Q9P232 1028 aa9.93□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRIM17Q9Y577 477 aa9.93□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTPRJQ12913 1337 aa9.93□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-202ENST00000444658 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 LRRN2O75325 713 aa9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPS6KA5O75582 802 aa9.92□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-202ENST00000444658 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 P4HA1P13674 534 aa9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRLRP16471 622 aa9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDK7P50613 346 aa9.92□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-202ENST00000444658 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 CYP27A1Q02318 531 aa9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARID5AQ03989 594 aa9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBXN11Q5T124 520 aa9.92□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-202ENST00000444658 UBR7Q8N806 425 aa9.92□□□□□ -0.82
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