RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 C2CD6Q53TS8 623 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 SGO2Q562F6 1265 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 CENPTQ96BT3 561 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM11Q96F44 468 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 MAF1Q9H063 256 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 ADAM7Q9H2U9 754 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 OATP04181 439 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 ICAM3P32942 547 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 ARL2P36404 184 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 PIK3CAP42336 1068 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 MMP13P45452 471 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 FSTL1Q12841 308 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF302Q9NR11 478 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 CHST7Q9NS84 486 aa17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 FZD9O00144 591 aa17.08■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 CFHP08603 1231 aa17.08■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 NAMPTP43490 491 aa17.08■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 NSFP46459 744 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa17.08■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa17.08■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 ERMARDQ5T6L9 678 aa17.08■□□□□ 0.33
SHQ1-202ENST00000444040 TLDC2A0PJX2 215 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA0754O94854 1291 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 EDN1P05305 212 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 KRT17Q04695 432 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 ADCY2Q08462 1091 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 CUL2Q13617 745 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 PPP1R7Q15435 360 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 C6orf118Q5T5N4 469 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 RHBDF2Q6PJF5 856 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 OTUD6BQ8N6M0 293 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 KLRG1Q96E93 195 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 AZI2Q9H6S1 392 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 AAASQ9NRG9 546 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 WHRNQ9P202 907 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 UMODL1Q5DID0 1318 aa17.08■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 IVDP26440 423 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 PTP4A2Q12974 167 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 STXBP2Q15833 593 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 LCTP09848 1927 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 A0A0B4J269 797 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 K7ERI5 159 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 PROSCO94903 275 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 AGTP01019 485 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 NOMO3P69849 1222 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 CALCOCO2Q13137 446 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 SLFN12LQ6IEE8 588 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 CROCCP2Q86T23 111 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 ATG4AQ8WYN0 398 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 KAT2BQ92831 832 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 CNTN6Q9UQ52 1028 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 ADGRA2Q96PE1 1338 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa17.07■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 LRRIQ4A6NIV6 560 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 SNX1Q13596 522 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 DEPTORQ8TB45 409 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 MAIP1Q8WWC4 291 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 FBXO40Q9UH90 709 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 O00370 1275 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 LDHAP00338 332 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 CHN1P15882 459 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 BAG6P46379 1132 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 CNTN2Q02246 1040 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 IFT88Q13099 833 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 DNERQ8NFT8 737 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 CGRRF1Q99675 332 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 DCLK3Q9C098 648 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 SMIM23A6NLE4 172 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 FSBPO95073 299 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 PTK6Q13882 451 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM270Q6UE05 265 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM72Q6ZMU5 477 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 ARMC9Q7Z3E5 817 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 OR5B17Q8NGF7 314 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 VCPIP1Q96JH7 1222 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 C11orf70Q9BRQ4 267 aa17.06■□□□□ 0.32
SHQ1-202ENST00000444040 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms