RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C2CD2L	O14523	706 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CETP	P11597	493 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UQCRB	P14927	111 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHN2	P52757	468 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASIC1	P78348	528 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDK3	Q15120	406 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TGFBI	Q15582	683 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASIC2	Q16515	512 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TPK1	Q9H3S4	243 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAGPA	Q9UK23	515 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AMFR	Q9UKV5	643 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADAMTS3	O15072	1205 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLPTM1	O96005	669 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PGM1	P36871	562 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBA7	P41226	1012 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARPC4	P59998	168 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASPH	Q12797	758 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INA	Q16352	499 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KYNU	Q16719	465 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DRC3	Q9H069	523 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PARP2	Q9UGN5	583 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		11.09	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658		F8W8V4	182 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPAG7	O75391	227 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRPC1	P48995	793 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACADVL	P49748	655 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPIDR	Q14159	915 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ART4	Q93070	314 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM161B	Q96MY7	647 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NPHS2	Q9NP85	383 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYLD	Q9NQC7	956 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NDC80	O14777	642 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CPA3	P15088	417 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AP2B1	P63010	937 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AADACL2	Q6P093	401 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC6	Q86X45	466 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GBA3	Q9H227	469 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GREM2	Q9H772	168 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCB11	O95342	1321 aa		11.08	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PODXL	O00592	558 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHF2	O75151	1096 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MUT	P22033	750 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	S100A1	P23297	94 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPS15	P42566	896 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STT3A	P46977	705 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MMEL1	Q495T6	779 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTC27	Q6P3X3	843 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PACS1	Q6VY07	963 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VPS50	Q96JG6	964 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CGREF1	Q99674	301 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		11.07	□□□□□ -0.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64

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