RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 GPD1LQ8N335 351 aa23.02■■□□□ 1.28
TMEM200B-201ENST00000420504 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
TMEM200B-201ENST00000420504 PLSCR1O15162 318 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 UBOX5O94941 541 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 ATP6V1G2O95670 118 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 ENPEPQ07075 957 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 CKAP2Q8WWK9 683 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF516Q92618 1163 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 GGT7Q9UJ14 662 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 ANAPC5Q9UJX4 755 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 THAP12O43422 761 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 MAP3K10Q02779 954 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 CENPCQ03188 943 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 GALNTL6Q49A17 601 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 CYP4X1Q8N118 509 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 OGFOD1Q8N543 542 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 MLXIPLQ9NP71 852 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.01■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 PROSCO94903 275 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 GH1P01241 217 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 RALAP11233 206 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 CETPP11597 493 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 ADCY8P40145 1251 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 MON1BQ7L1V2 547 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM83AQ86UY5 434 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF677Q86XU0 584 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 TRIM11Q96F44 468 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 LGALS13Q9UHV8 139 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 CFAP73A6NFT4 308 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 NUGGCQ68CJ6 796 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 RPAINQ86UA6 219 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 RMDN3Q96TC7 470 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM213AQ9BRX8 229 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 HEMGNQ9BXL5 484 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 NOD2Q9HC29 1040 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 PXMP2Q9NR77 195 aa23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF862O60290 1169 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 BRAFP15056 766 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 GARTP22102 1010 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 VPS41P49754 854 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 DGKZQ13574 1117 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 NEDD9Q14511 834 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 COL4A5P29400 1685 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 C21orf2O43822 256 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 STBD1O95210 358 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC8A1P32418 973 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 NCALDP61601 193 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 SUN1O94901 812 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 CLDN10P78369 228 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 CCNG2Q16589 344 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 RELL1Q8IUW5 271 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 LPAR1Q92633 364 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM212AQ96EL1 285 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 EURLQ9NYK6 297 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 FDX1P10109 184 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 TAS2R40P59535 323 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 RIPK1Q13546 671 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 RDM1Q8NG50 284 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 TCP11Q8WWU5 503 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 CEP170P1Q96L14 293 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 PSTPIP1O43586 416 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 GJB6O95452 261 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 CFHP08603 1231 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 DSG3P32926 999 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 GDAP1Q8TB36 358 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM200B-201ENST00000420504 CDH16O75309 829 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms