RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 PP2D1A8MPX8 630 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 H7C4K7 107 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 ECI2O75521 394 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 MCM4P33991 863 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 KRT79Q5XKE5 535 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 TSSK4Q6SA08 328 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 RTL10Q7L3V2 364 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 TCEAL4Q96EI5 215 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 GDE1Q9NZC3 331 aa21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 SFI1A8K8P3 1242 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 SLC16A4O15374 487 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 NCAM2O15394 837 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 PTGDRQ13258 359 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 SEZ6Q53EL9 994 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 ELMOD1Q8N336 334 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 DRC1Q96MC2 740 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 BRD9Q9H8M2 597 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 STK24Q9Y6E0 443 aa21.15■□□□□ 0.98
UBXN4-202ENST00000415164 SEC24AO95486 1093 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MCF2P10911 925 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 CPB1P15086 417 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 CDC25AP30304 524 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TRAPPC10P48553 1259 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 STRN3Q13033 797 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.14■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF197O14709 1029 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SYN3O14994 580 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SPTLC1O15269 473 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SEC24BO95487 1268 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MYL4P12829 197 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ATF2P15336 505 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MAGEA9P43362 315 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PDIA5Q14554 519 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 IQCEQ6IPM2 695 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF280DQ6N043 979 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 POTEHQ6S545 545 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ALKAL1Q6UXT8 129 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 DAW1Q8N136 415 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SUMF1Q8NBK3 374 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ELSPBP1Q96BH3 223 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 NELL2Q99435 816 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 FRYLO94915 3013 aa21.13■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ABLIM3O94929 683 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 GJA1P17302 382 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ADCY1Q08828 1119 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TWF1Q12792 350 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 XKR4Q5GH76 650 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PLIN2Q99541 437 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 CNTN3Q9P232 1028 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.12■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 KCNE1P15382 129 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 GDI1P31150 447 aa21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
UBXN4-202ENST00000415164 CCR2P41597 374 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms