RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409972.5

RBMS1-205, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-205ENST00000409972 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 ASB7Q9H672 318 aa23.42■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 SNTG2Q9NY99 539 aa23.42■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 HES2Q9Y543 173 aa23.42■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.42■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 KRT86O43790 486 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC172P0C7W6 258 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 MGAT3Q09327 533 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 KIF5AQ12840 1032 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 PTGISQ16647 500 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 UBXN11Q5T124 520 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 RPAINQ86UA6 219 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 SLC35F6Q8N357 371 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 CXorf38Q8TB03 319 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 SIX4Q9UIU6 781 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.41■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 ACO1P21399 889 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 CUL2Q13617 745 aa23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 SLC47A2Q86VL8 602 aa23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 PALB2Q86YC2 1186 aa23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 C1orf127Q8N9H9 656 aa23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 CABYRO75952 493 aa23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 TNNC2P02585 160 aa23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 CTSHP09668 335 aa23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 NAB2Q15742 525 aa23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 EPS8L1Q8TE68 723 aa23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 AGPAT1Q99943 283 aa23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 XYLT2Q9H1B5 865 aa23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RBMS1-205ENST00000409972 CALCAP01258 141 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 CHRNB2P17787 502 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 RSPH3Q86UC2 560 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 FAM81BQ96LP2 452 aa23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 MOXD2PA6NHM9 499 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 CASQ1P31415 396 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 TRPC3Q13507 836 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 VPS36Q86VN1 386 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 TSGA10Q9BZW7 698 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 M0QZ92 97 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 TNFAIP3P21580 790 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 GUCY2FP51841 1108 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.38■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 KRT5P13647 590 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 CYP11B1P15538 503 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 THPOP40225 353 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 TMEM132DQ14C87 1099 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 ALKAL1Q6UXT8 129 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 SNX27Q96L92 541 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 PCDHB18PQ96TA0 734 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.334e-7■■■■■ 32.7
RBMS1-205ENST00000409972 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 RNF39Q9H2S5 420 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.37■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 ITGB3P05106 788 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 AKAP5P24588 427 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 UBR7Q8N806 425 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 C2CD2Q9Y426 696 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 A0A1W2PQY0 241 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 FAM170AA1A519 330 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 RPS6KA5O75582 802 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 KRT19P08727 400 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 PTK7Q13308 1070 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 TAF3Q5VWG9 929 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 CD302Q8IX05 232 aa23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RBMS1-205ENST00000409972 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms