RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 HLA-DRAP01903 254 aa29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 SKIP12755 728 aa29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNJ6P48051 423 aa29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 XKR4Q5GH76 650 aa29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 IQCDQ96DY2 449 aa29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZFP42Q96MM3 310 aa29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLCB1Q9NQ66 1216 aa29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ENPP3O14638 875 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 CST3P01034 146 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIK3CAP42336 1068 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 VWCEQ96DN2 955 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABHD8Q96I13 439 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 PI4K2AQ9BTU6 479 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 GANQ9H2C0 597 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGAP6O43182 974 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 MLH1P40692 756 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 GUCY2FP51841 1108 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 GJB7Q6PEY0 223 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 NT5DC4Q86YG4 428 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf127Q8N9H9 656 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 GAD1Q99259 594 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 GIT1Q9Y2X7 761 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 DERAQ9Y315 318 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 RFC2P35250 354 aa29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM189BP81408 668 aa29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 PGBD4Q96DM1 585 aa29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf112Q9NSG2 853 aa29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PQJ5 194 aa29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNE1P15382 129 aa29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCOA4Q13772 614 aa29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZBTB6Q15916 424 aa29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 NLRC4Q9NPP4 1024 aa29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARL5CA6NH57 179 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTGESO14684 152 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 UCHL3P15374 230 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSF2RAP15509 400 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 MFSD5Q6N075 450 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSTCDQ8NEC7 633 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR8K1Q8NGG5 319 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 RSAD1Q9HA92 442 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 DPP3Q9NY33 737 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 APEX2Q9UBZ4 518 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLAGL2Q9UPG8 496 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 FHOD1Q9Y613 1164 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITGB3P05106 788 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT19P08727 400 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 FECHP22830 423 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGEF19Q8IW93 802 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNAJC7Q99615 494 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 MIOSQ9NXC5 875 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEP72Q9P209 647 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIX4Q9UIU6 781 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 EOMESO95936 686 aa29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZBED6P86452 979 aa29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 CXorf38Q8TB03 319 aa29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCND1Q9NSA2 647 aa29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYL6P60660 151 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRPC3Q13507 836 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPOPLQ6IQ16 392 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNKSR3Q6P9H4 555 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 C7orf61Q8IZ16 206 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM199Q8N511 208 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TATDN2Q93075 761 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS6KC1Q96S38 1066 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
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TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 RRAGAQ7L523 313 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 BEST2Q8NFU1 509 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBN1Q9NPG3 1134 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 SOWAHDA6NJG2 315 aa29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 USP27XA6NNY8 438 aa29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCNN1GP51170 649 aa29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR44Q5JSH3 913 aa29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 BAP1Q92560 729 aa29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 NT5C1BQ96P26 610 aa29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSPAN18Q96SJ8 248 aa29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNAJC12Q9UKB3 198 aa29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITGA11Q9UKX5 1188 aa29.84■■■□□ 2.37
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