RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 ENPEPQ07075 957 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 PARP9Q8IXQ6 854 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 TTC4O95801 387 aa26.95■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 WDR44Q5JSH3 913 aa26.95■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.95■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 DYDC1Q8WWB3 177 aa26.95■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 VPS33BQ9H267 617 aa26.95■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
C9orf40-201ENST00000376854 STBD1O95210 358 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 ATP5DP30049 168 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 CCND2P30279 289 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 ADCY8P40145 1251 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 LRRC14Q15048 493 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 TAS1R3Q7RTX0 852 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 CCDC50Q8IVM0 306 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 ATL2Q8NHH9 583 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 MGARPQ8TDB4 240 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 ANAPC5Q9UJX4 755 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 DGAT1O75907 488 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 BPIFB4P59827 614 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 CAV1Q03135 178 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 SWSAP1Q6NVH7 229 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 VSIG10LQ86VR7 867 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 GPRASP2Q96D09 838 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 HEMGNQ9BXL5 484 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 RIPK3Q9Y572 518 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM120BA0PK00 339 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 RALAP11233 206 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 CENPCQ03188 943 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 KYNUQ16719 465 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 XRRA1Q6P2D8 792 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 IFT74Q96LB3 600 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 SCLT1Q96NL6 688 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 PDLIM7Q9NR12 457 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 THAP12O43422 761 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 EXTL3O43909 919 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 PROSCO94903 275 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 NR3C2P08235 984 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 CREB1P16220 341 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 VPS41P49754 854 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 SNCBQ16143 134 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 MON1BQ7L1V2 547 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 FNBP1Q96RU3 617 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 TNNI1P19237 187 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 POTEAQ6S8J7 498 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 ATG4CQ96DT6 458 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 RNF146Q9NTX7 359 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 SLC12A4Q9UP95 1085 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 VWA5AO00534 786 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 HLA-DRAP01903 254 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 PIK3CAP42336 1068 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 LIG4P49917 911 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 RTP1P59025 263 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 SP4Q02446 784 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 PTP4A2Q12974 167 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 VSTM1Q6UX27 236 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 O00370 1275 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 SORBS3O60504 671 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 PSAPP07602 524 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 GSTA1P08263 222 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 PSMD6Q15008 389 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 ZACNQ401N2 412 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 LIN9Q5TKA1 542 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 SPOPLQ6IQ16 392 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 CCDC91Q7Z6B0 441 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 KIAA1586Q9HCI6 787 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 TELO2Q9Y4R8 837 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 UMODL1Q5DID0 1318 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 SNX3O60493 162 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 KCNA2P16389 499 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 CLDN10P78369 228 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 JDP2Q8WYK2 163 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 PWWP2AQ96N64 755 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 C11orf70Q9BRQ4 267 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 KCNK9Q9NPC2 374 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf40-201ENST00000376854 CYP26B1Q9NR63 512 aa26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms