RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355633.5

HOXA1-202, Transcript of homeobox A1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA1, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1-202ENST00000355633 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 SHC3Q92529 594 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 SNX27Q96L92 541 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 APOL6Q9BWW8 343 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 RECQL4O94761 1208 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 GHRP10912 638 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 USP8P40818 1118 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 MYL6P60660 151 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 CYP27A1Q02318 531 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 KIF12Q96FN5 646 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 CHST12Q9NRB3 414 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ZNF263O14978 683 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 KRT19P08727 400 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 CKBP12277 381 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 TNNT1P13805 278 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ANXA13P27216 316 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 PAK2Q13177 524 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 SLC18A3Q16572 532 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 KIAA1328Q86T90 577 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 VPS36Q86VN1 386 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 PADI3Q9ULW8 664 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 DERAQ9Y315 318 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 IPPQ9Y573 584 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 TRIP11Q15643 1979 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 A0A0U1RQJ8 604 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ITGB3P05106 788 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 AKAP5P24588 427 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 CD52P31358 61 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 CDK7P50613 346 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 CUL2Q13617 745 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ZNF699Q32M78 642 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 USP38Q8NB14 1042 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 ARID3AQ99856 593 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 CNTN3Q9P232 1028 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 PARP2Q9UGN5 583 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 SQORQ9Y6N5 450 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA1-202ENST00000355633 A0A087X0T9 212 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 FAM228BP0C875 321 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 VAV2P52735 878 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 LPIN1Q14693 890 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 SIX4Q9UIU6 781 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 CYP26A1O43174 497 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 KRT5P13647 590 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 TAF4BQ92750 862 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 RNF39Q9H2S5 420 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 DPP3Q9NY33 737 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 ATICP31939 592 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 MAGEA1P43355 309 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 HACE1Q8IYU2 909 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 CXorf38Q8TB03 319 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 CAGE1Q8TC20 777 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 ZNF333Q96JL9 665 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 KLK14Q9P0G3 267 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA1-202ENST00000355633 BRCA2P51587 3418 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms