RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 KRT86O43790 486 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 CHRNA1P02708 482 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ANXA13P27216 316 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 MYL6P60660 151 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 HES2Q9Y543 173 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.09■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 RPS6KA5O75582 802 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 KRT19P08727 400 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 KRT5P13647 590 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 CUL2Q13617 745 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 RPAINQ86UA6 219 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 APOL6Q9BWW8 343 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.08■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 A0A1W2PQY0 241 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 CYP26A1O43174 497 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 MGAT3Q09327 533 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 PTK7Q13308 1070 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.08■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 KBTBD13C9JR72 458 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.122e-6■□□□□ 9.5
TRIM4-202ENST00000354241 SGPL1O95470 568 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 TNFAIP3P21580 790 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 CD302Q8IX05 232 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 WDR24Q96S15 920 aa22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF699Q32M78 642 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 UBXN11Q5T124 520 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 KIF12Q96FN5 646 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 AGPAT1Q99943 283 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 WBP1LQ9NX94 342 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 NAGPAQ9UK23 515 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 ITGB3P05106 788 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 CASQ1P31415 396 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 SNX27Q96L92 541 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 SYT11Q9BT88 431 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 C2CD2Q9Y426 696 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.06■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 RECQL4O94761 1208 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 AKAP5P24588 427 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 NAB2Q15742 525 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 ACP6Q9NPH0 428 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 SIX4Q9UIU6 781 aa22.05■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 PJA2O43164 708 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 PDE6CP51160 858 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 GUCY2FP51841 1108 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 TAF3Q5VWG9 929 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 SLC35F6Q8N357 371 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 PHF24Q9UPV7 400 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 FANCGO15287 622 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 MTFR1Q15390 333 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.04■■□□□ 1.12
TRIM4-202ENST00000354241 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.04■■□□□ 1.12
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