RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320054.4

PRPF18-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF18, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18-201ENST00000320054 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 IQCDQ96DY2 449 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 NUP58Q9BVL2 599 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 RAB20Q9NX57 234 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 DPP3Q9NY33 737 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.68□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 SYN1P17600 705 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 SLC9A1P19634 815 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 PIK3CAP42336 1068 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 SCNN1GP51170 649 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 NCOA4Q13772 614 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 NAB2Q15742 525 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 URGCPQ8TCY9 931 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 TAF4BQ92750 862 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 SEMA4DQ92854 862 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 FAM84AQ96KN4 292 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 SIX2Q9NPC8 291 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 MIOSQ9NXC5 875 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 SIX4Q9UIU6 781 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 COL4A6Q14031 1691 aa14.67□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 CEP290O15078 2479 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 ANO9A1A5B4 782 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 ITGB3P05106 788 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 FGFR1P11362 822 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 LRPAP1P30533 357 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 ATICP31939 592 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 RBP5P82980 135 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 TRPC3Q13507 836 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 TRIM14Q14142 442 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 TMEM240Q5SV17 173 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 ZNF365Q70YC5 407 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 TMC6Q7Z403 805 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 ABI1Q8IZP0 508 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 NEK11Q8NG66 645 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 HELQQ8TDG4 1101 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 TOP1MTQ969P6 601 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 PIRO00625 290 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 DGKIO75912 1065 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 NOL4O94818 638 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 RFX1P22670 979 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 KCNJ6P48051 423 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 KLK7P49862 253 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 EPHB4P54760 987 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 TUSC3Q13454 348 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 PTPN21Q16825 1174 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 WDR44Q5JSH3 913 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 DRC7Q8IY82 874 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 HERVK_113Q902F9 699 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 FAM81BQ96LP2 452 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 UROC1Q96N76 676 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 NT5C1BQ96P26 610 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 CASD1Q96PB1 797 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 GANQ9H2C0 597 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF18-201ENST00000320054 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms