RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 GYPCP04921 128 aa29.56■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASP14P31944 242 aa29.56■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC186Q7Z3E2 898 aa29.56■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EDEM3Q9BZQ6 932 aa29.56■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXCL16Q9H2A7 254 aa29.56■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP72Q9P209 647 aa29.56■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa29.56■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PQJ5 194 aa29.55■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 THP07101 528 aa29.55■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TCTN1Q2MV58 587 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNGA4Q8IV77 575 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf127Q8N9H9 656 aa29.55■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa29.55■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa29.55■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SIX2Q9NPC8 291 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa29.55■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PTGESO14684 152 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPHB6O15197 1021 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFCAB14O75071 495 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP3A5P20815 502 aa29.54■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 PI4K2AQ9BTU6 479 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTYH3Q9C0H2 523 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL23AQ9NPF7 189 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 NLRC4Q9NPP4 1024 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGAP1Q9UPQ3 857 aa29.54■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXA2O43364 376 aa29.53■■■□□ 2.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOL4O94818 638 aa29.53■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GUCY2FP51841 1108 aa29.52■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF699Q32M78 642 aa29.52■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TNS4Q8IZW8 715 aa29.52■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MFAP3P55082 362 aa29.51■■■□□ 2.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NOMO2Q5JPE7 1267 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 IQCEQ6IPM2 695 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 GJB7Q6PEY0 223 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRAGAQ7L523 313 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSTCDQ8NEC7 633 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 MIOSQ9NXC5 875 aa29.5■■■□□ 2.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASS1P00966 412 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
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