RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ARFIP2P53365 341 aa17.31■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TRABDQ9H4I3 376 aa17.31■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TMEM8AQ9HCN3 771 aa17.31■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ZHX2Q9Y6X8 837 aa17.31■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ITGA8P53708 1063 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 EPHB1P54762 984 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 OCRLQ01968 901 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 GRAMD1AQ96CP6 724 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 FAM86B1E9PN63 330 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 PDHA1P08559 390 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 FAM86B2P0C5J1 330 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 CDR2Q01850 454 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 Q4G0T1 1027 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 VPS11Q9H270 941 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 SMYD3Q9H7B4 428 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 GPRC5CQ9NQ84 441 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ASNSD1Q9NWL6 643 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 DGAT1O75907 488 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 LMNAP02545 664 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 KRT7P08729 469 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 KITP10721 976 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 CASP5P51878 434 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 KIF22Q14807 665 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF568Q3ZCX4 644 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 CBWD2Q8IUF1 395 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 SGSM3Q96HU1 749 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF302Q9NR11 478 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa17.3■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 CFAP69A5D8W1 941 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 PPFIA2O75334 1257 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TTMPQ5BVD1 217 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ANKMY2Q8IV38 441 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ATP11CQ8NB49 1132 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 VPS39Q96JC1 886 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 NPY5RQ15761 445 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 C4orf33Q8N1A6 199 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TSC22D3Q99576 134 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 MGEA5O60502 916 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 RHBDL3P58872 404 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 C1orf146Q5VVC0 180 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ATG4AQ8WYN0 398 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 GNGT2O14610 69 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 KCNA1Q09470 495 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 CATSPER4Q7RTX7 472 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ATP8B4Q8TF62 1192 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 SDC4P31431 198 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 FNTAP49354 379 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 BCAR1P56945 870 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 PTENP60484 403 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF844Q08AG5 666 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TMEM143Q96AN5 459 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC138Q96M89 665 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 WRNIP1Q96S55 665 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TTC1Q99614 292 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF263O14978 683 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 HIF1AQ16665 826 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 C2CD6Q53TS8 623 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 KIF2BQ8N4N8 673 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 FAM151AQ8WW52 585 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 SLC13A1Q9BZW2 595 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 GOLGA8CPA6NN73 597 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 HLA-DRAP01903 254 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 SKOR1P84550 965 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TMTC4Q5T4D3 741 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TRIM67Q6ZTA4 783 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 NT5DC3Q86UY8 548 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 PACS2Q86VP3 889 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 METTL23Q86XA0 190 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 GMCL1Q96IK5 515 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 NCAPGQ9BPX3 1015 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 HAUS8Q9BT25 410 aa17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms