RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264331.8

TOP2B-201, Transcript of DNA topoisomerase II beta, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TOP2B, Length 5,358 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2B-201ENST00000264331 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 ASAP2O43150 1006 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 NDUFV1P49821 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 MYL6P60660 151 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 VSTM1Q6UX27 236 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 ZBTB33Q86T24 672 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 FAM107BQ9H098 131 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 GPR39O43194 453 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 KIF5BP33176 963 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 GSDMDP57764 484 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 PDE4CQ08493 712 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 PEX6Q13608 980 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 MTMR1Q13613 665 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 DLGAP5Q15398 846 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 MTERF2Q49AM1 385 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 ACCSLQ4AC99 568 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 C9orf72Q96LT7 481 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 NUP58Q9BVL2 599 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 GDF3Q9NR23 364 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CYB561D2O14569 222 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 TMEM63AO94886 807 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 ICAM1P05362 532 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CCT5P48643 541 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 ACTR2P61160 394 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 BFSP1Q12934 665 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 LONRF1Q17RB8 773 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 TMEM209Q96SK2 561 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 DENND3A2RUS2 1198 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 AXIN1O15169 862 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 KIF4AO95239 1232 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CA5AP35218 305 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 BACE1P56817 501 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 TRPV1Q8NER1 839 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CYP11B1P15538 503 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 SNX31Q8N9S9 440 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CCDC42Q96M95 316 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 ZNF358Q9NW07 568 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 MIOSQ9NXC5 875 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CCDC151A5D8V7 595 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 PSMA7O14818 248 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 HOXC6P09630 235 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CXCL8P10145 99 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 TUBP50607 506 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 GPNMBQ14956 572 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 MYLIPQ8WY64 445 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 SYT17Q9BSW7 474 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CLUHO75153 1309 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 CACNA1CQ13936 2221 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 MASP1P48740 699 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP2B-201ENST00000264331 GPX6P59796 221 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms