RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 C16orf87Q6PH81 154 aa14.56□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 EFHBQ8N7U6 833 aa14.56□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.56□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 EHD4Q9H223 541 aa14.56□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.56□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.56□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 PODXLO00592 558 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 MAN1A2O60476 641 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 PDGFRAP16234 1089 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 RNF208Q9H0X6 261 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 FOXN1O15353 648 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ACSL3O95573 720 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 CLCN3P51790 818 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 SZRD1Q7Z422 152 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 CEP19Q96LK0 163 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 VPS33BQ9H267 617 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 NDFIP2Q9NV92 336 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 KLK14Q9P0G3 267 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 DNAJC6O75061 913 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 GGCXP38435 758 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 TAF6P49848 677 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 OCRLQ01968 901 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 OCA2Q04671 838 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 SH3GL3Q99963 347 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 SENP2Q9HC62 589 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 NAGPAQ9UK23 515 aa14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 IL1R1P14778 569 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 DDR1Q08345 913 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 KIZQ2M2Z5 673 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ZBTB22O15209 634 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 SLC26A4O43511 780 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 KRT38O76015 456 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 EGFL8Q99944 293 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 SNX24Q9Y343 169 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 PNPLA4P41247 253 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 CDCA5Q96FF9 252 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 A0A0G2JND7 137 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 STRNO43815 780 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 CYP11B2P19099 503 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ROR1Q01973 937 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 MUC3BQ9H195 1237 aa14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 TNS2Q63HR2 1409 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 KPNA6O60684 536 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 IL31Q6EBC2 164 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 SNX19Q92543 992 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 MYMKA6NI61 221 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ATP5HO75947 161 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 URODP06132 367 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 10.2
USP22-201ENST00000261497 SCP2P22307 547 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 TROAPQ12815 778 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 TTC8Q8TAM2 541 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 TMEM247A6NEH6 219 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.086e-33■■■■■ 133.5
USP22-201ENST00000261497 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 GMCL1Q96IK5 515 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 HPDLQ96IR7 371 aa14.53□□□□□ -0.08
USP22-201ENST00000261497 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms