RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000167588.3

KRT20-201, Transcript of keratin 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRT20, Length 1,737 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20-201ENST00000167588 ACTL7BQ9Y614 415 aa16.08■□□□□ 0.17
KRT20-201ENST00000167588 NFASCO94856 1347 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CFAP73A6NFT4 308 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 MGRN1O60291 552 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 SNX3O60493 162 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 RRM1P23921 792 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CHKAP35790 457 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ITGA8P53708 1063 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CCNG2Q16589 344 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ZACNQ401N2 412 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 LIN9Q5TKA1 542 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ARHGEF16Q5VV41 709 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 VSTM1Q6UX27 236 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CPXCR1Q8N123 301 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 STYXL1Q9Y6J8 313 aa16.08■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ZNF862O60290 1169 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ZBED4O75132 1171 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ABHD2P08910 425 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 POTEJP0CG39 1038 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 LONRF1Q17RB8 773 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 WLSQ5T9L3 541 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 TAS1R3Q7RTX0 852 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CEP170P1Q96L14 293 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 HOMER2Q9NSB8 354 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 NINJ2Q9NZG7 142 aa16.07■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 LCTP09848 1927 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 TMEM120BA0PK00 339 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 O00370 1275 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ACSL3O95573 720 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 PIGRP01833 764 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 PSAPP07602 524 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 KCNA2P16389 499 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 RDXP35241 583 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 WDR44Q5JSH3 913 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CCDC89Q8N998 374 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 EXD1Q8NHP7 514 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ZNF516Q92618 1163 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 IFT74Q96LB3 600 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 NCAPGQ9BPX3 1015 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 MAF1Q9H063 256 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ANAPC5Q9UJX4 755 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 SCINQ9Y6U3 715 aa16.06■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 HLA-DRAP01903 254 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ACO1P21399 889 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 SNX1Q13596 522 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 STAT4Q14765 748 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 FAM212AQ96EL1 285 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 MTFR1LQ9H019 292 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 GABBR1Q9UBS5 961 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ZNRF3Q9ULT6 936 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 THAP12O43422 761 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CDH16O75309 829 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 SLC8A1P32418 973 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 NOMO3P69849 1222 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 RIPK1Q13546 671 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CCDC38Q502W7 563 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 BICD1Q96G01 975 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 CDHR1Q96JP9 859 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 SCLT1Q96NL6 688 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.05■□□□□ 0.16
KRT20-201ENST00000167588 TRIM7Q9C029 511 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms