RNA–Protein interactions for RNA: YLL009C

COX17, Transcript of Copper metallochaperone that transfers copper to Sco1p and Cox11p, yeast

Gene COX17, Length 210 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COX17	YLL009C	TAF9	Q05027	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	POM152	P39685	1337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	MET5	P47169	1442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	LSB5	P25369	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	TRS65	P32893	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	ATG12	P38316	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	TRR2	P38816	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	AIM25	P47140	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YIP1	P53039	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	PRM8	P53174	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YNL184C	P53876	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SUR7	P54003	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	AIM36	Q03798	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SHH4	Q06236	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	GAT3	Q07928	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	THI20	Q08224	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	IRC13	Q08630	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	RFM1	Q12192	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	ORT1	Q12375	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SNF4	P12904	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	ERD2	P18414	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	NUP1	P20676	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	AHC2	P25649	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SNC2	P33328	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	MRPL39	P36533	70 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SOL2	P37262	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	OST2	P46964	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	MNN5	P46982	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	ORC5	P50874	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	FLC3	P53121	802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	VHT1	P53241	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YGR151C	P53287	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SLM2	P53955	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	TSA2	Q04120	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SPG4	Q04438	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	USV1	Q12132	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	PHO85	P17157	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	PCL1	P24867	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	BUB3	P26449	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YMC1	P32331	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	PTC1	P35182	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YOR062C	P36025	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	PRY2	P36110	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YCR041W	P37265	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	PEX7	P39108	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	MOB1	P40484	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	APQ12	P40532	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	RPE1	P46969	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	GWT1	P47026	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	XPT1	P47165	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YGL101W	P53144	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	NMA2	P53204	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	HST4	P53688	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	AIM11	P87275	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	HPF1	Q05164	967 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	LIP2	Q06005	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	COQ10	Q08058	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YAP7	Q08182	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	FCY1	Q12178	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	FRE8	Q12209	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	BNR1	P40450	1375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	TIR2	P33890	251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	APS1	P35181	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SRY1	P36007	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	MRP21	P38175	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	ARN1	P38731	627 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	PCL5	P38794	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	BUL1	P48524	976 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	UBC12	P52491	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	SCW11	P53189	542 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YGR039W	P53225	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	ATP23	P53722	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YDR366C	P87287	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	FDH1	Q08911	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	MCT1	Q12283	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	EAF3	Q12432	401 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	CDC6	P09119	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COX17	YLL009C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 70.2 ms