RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W BUD8P41698 603 aa11.4□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SMK1P41808 388 aa11.4□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YLR152CP54072 576 aa11.4□□□□□ -0.58
SSA4YER103W MRX8Q05473 314 aa11.4□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YCT1Q12235 531 aa11.4□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SSH4P32343 579 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YKL071WP36086 256 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W HRT1Q08273 121 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W QCR2P07257 368 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W AGP1P25376 633 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YJU3P28321 313 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W ERG3P32353 365 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W GAT2P40209 560 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YIL067CP40514 678 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W ALG9P53868 555 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W XYL2Q07993 356 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W MCT1Q12283 360 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W IZH2Q12442 317 aa11.39□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RPS13P05756 151 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
SSA4YER103W SAC7P17121 654 aa11.38□□□□□ -0.59
SSA4YER103W GAS1P22146 559 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
SSA4YER103W WSS1P38838 269 aa11.38□□□□□ -0.59
SSA4YER103W GLC8P41818 229 aa11.38□□□□□ -0.59
SSA4YER103W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SSA4YER103W ALG12P53730 551 aa11.38□□□□□ -0.59
SSA4YER103W SAE3P89114 91 aa11.38□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RSM23Q01163 450 aa11.38□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YLR111WQ12528 110 aa11.38□□□□□ -0.59
SSA4YER103W SUI1P32911 108 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W SSH1P38353 490 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YBR292CP38357 123 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W FLO5P38894 1075 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RSM7P47150 247 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RMD9P53140 646 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W STD1Q02794 444 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W GDH1P07262 454 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W OLE1P21147 510 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W MRS4P23500 304 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W TRS65P32893 560 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W MOT2P34909 587 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W ANS1P38832 159 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W PAU5P43575 122 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YNR066CP53752 436 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W VPS28Q02767 242 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W EKI1Q03764 534 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W ATG10Q07879 167 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YDR262WQ12331 272 aa11.37□□□□□ -0.59
SSA4YER103W FMP10P40098 244 aa11.36□□□□□ -0.59
SSA4YER103W NAS2P40555 220 aa11.36□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YGR149WP48236 432 aa11.36□□□□□ -0.59
SSA4YER103W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W STP22P25604 385 aa11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W ARO4P32449 370 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W SRB5P32585 307 aa11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W ELF1P36053 145 aa11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W AGE2P40529 298 aa11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YGR066CP53242 292 aa11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YKR104WP0CE69 306 aa11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W STE4P18851 423 aa11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W DEG1P31115 442 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W TRM7P38238 310 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W MTO1P53070 669 aa11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W MRP51Q02950 344 aa11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W VPS68Q12016 184 aa11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W POM33Q12164 279 aa11.35□□□□□ -0.59
SSA4YER103W YLR358CO13565 187 aa11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W UMP1P38293 148 aa11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W SLM6P38343 150 aa11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W IRC22P40006 225 aa11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W NSA2P40078 261 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W THI74Q04083 370 aa11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W BDS1Q08347 646 aa11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RAX2Q12465 1220 aa11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SSA4YER103W BGL2P15703 313 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W MIR1P23641 311 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W AGA2P32781 87 aa11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W UPS2P35200 230 aa11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W GPP1P41277 250 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W LSB3P43603 459 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W FSH2Q05015 223 aa11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W PIN3Q06449 215 aa11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W ATG5Q12380 294 aa11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W ERP4Q12450 207 aa11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W LSB5P25369 354 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 96.1 ms