RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR3DS1	Q14943	382 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	TAF5	Q15542	800 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	RFX8	Q6ZV50	586 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	BRINP3	Q76B58	766 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	NLRX1	Q86UT6	975 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ESX1	Q8N693	406 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF152	Q8N8N0	203 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ASB12	Q8WXK4	309 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	SHISA4	Q96DD7	197 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK19	Q9BWU1	502 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	MSRA	Q9UJ68	235 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	FFAR2	O15552	330 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	NPHS1	O60500	1241 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	TOM1	O60784	492 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	POLB	P06746	335 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CKMT1A	P12532	417 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	GLUL	P15104	373 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ITGB5	P18084	799 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT15	P19012	456 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CNTF	P26441	200 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPA7	P48741	367 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKG1	Q13976	671 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	TAF12	Q16514	161 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNJ15	Q99712	375 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PQ27	194 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PQ64	194 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PQC6	194 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PQD8	194 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM253	P0C7T8	217 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP1A3	P13637	1013 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKCA	P17252	672 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS6KB1	P23443	525 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	MVK	Q03426	396 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	TAF11	Q15544	211 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	UGT8	Q16880	541 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	MPEG1	Q2M385	716 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	NUP43	Q8NFH3	380 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	RMDN3	Q96TC7	470 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ANO3	Q9BYT9	981 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF32	Q9H0A6	362 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC154	A6NI56	674 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	FRS3	O43559	492 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	PLOD3	O60568	738 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	TBX18	O95935	607 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	MSL3P1	P0C860	447 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXD12	P35452	270 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT9	P35527	623 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	TUB	P50607	506 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	GALK1	P51570	392 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	CORO7	P57737	925 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5

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