RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	GART	P22102	1010 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	GCNT1	Q02742	428 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	GINM1	Q9NU53	330 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	EXTL3	O43909	919 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	GTF2H1	P32780	548 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	GJC1	P36383	396 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	BAG6	P46379	1132 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	14	□□□□□ -0.17	2e-7	■■■■■ 43
BRF1-222	ENST00000635152	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SGO2	Q562F6	1265 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	XKR3	Q5GH77	459 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	DLK2	Q6UY11	383 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	MORC4	Q8TE76	937 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		14	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152		K7ERI5	159 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152		O00370	1275 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM270	Q6UE05	265 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	PACS2	Q86VP3	889 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	FAM107A	O95990	144 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	NF2	P35240	595 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	VPS41	P49754	854 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	TGFB2	P61812	414 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF302	Q9NR11	478 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.99	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	GMNC	A6NCL1	334 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA0754	O94854	1291 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	GJB6	O95452	261 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ECEL1	O95672	775 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	GGPS1	O95749	300 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	GLRA2	P23416	452 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	IFT88	Q13099	833 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ZACN	Q401N2	412 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	QPCT	Q16769	361 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	HOOK3	Q86VS8	718 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	RAPGEF5	Q92565	580 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.98	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	VNN1	O95497	513 aa		13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
BRF1-222	ENST00000635152	EDN1	P05305	212 aa		13.97	□□□□□ -0.17

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