RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 FOSBP53539 338 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB44Q8NCP5 570 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF25Q93038 417 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 EPC1Q9H2F5 836 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 GDE1Q9NZC3 331 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MIA3Q5JRA6 1907 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 LRG1P02750 347 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 TKTP29401 623 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 ELF1P32519 619 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 LMNB2Q03252 620 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC5A9Q2M3M2 681 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 EEF1DP3Q658K8 133 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKS3Q6ZW76 656 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 BSNDQ8WZ55 320 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN23Q96B33 292 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 GMEB2Q9UKD1 530 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 FANCMQ8IYD8 2048 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 FRYLO94915 3013 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 I3L4J1 428 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 ACKR2O00590 384 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC3O43617 180 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 CTDNEP1O95476 244 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 CEBPBP17676 345 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS9P46781 194 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 CLCNKBP51801 687 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 RTL10Q7L3V2 364 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF35A5YM69 484 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRG1O14668 218 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP8P85298 464 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ADCY1Q08828 1119 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 TANGO2Q6ICL3 276 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 NACC1Q96RE7 527 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 TUFT1Q9NNX1 390 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 BACE2Q9Y5Z0 518 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 DOCK6Q96HP0 2047 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT7AO00755 349 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D4O60343 1298 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 LILRB5O75023 590 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 BRCC3P46736 316 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM25P49756 843 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ARPP19P56211 112 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 MTAPQ13126 283 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 GRM2Q14416 872 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 CATSPER3Q86XQ3 398 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 UROC1Q96N76 676 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 MTMR9Q96QG7 549 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 CORO1BQ9BR76 489 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 BRD9Q9H8M2 597 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB23Q9ULC3 237 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 BTBD18B2RXH4 712 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 MED24O75448 989 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN2P17706 415 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 NAMPTP43490 491 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PADI6Q6TGC4 694 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 DNASE1L2Q92874 299 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ELSPBP1Q96BH3 223 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 KIFC3Q9BVG8 833 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC113Q9H0I3 377 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 EDN1P05305 212 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM29Q14134 588 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP2R5AQ15172 486 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 MAN2B1O00754 1011 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 FDPSP14324 419 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 MCM7P33993 719 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ROR1Q01973 937 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 LPAL2Q16609 132 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ATF7IP2Q5U623 682 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 NECAB1Q8N987 351 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 NELL1Q92832 810 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 IFT74Q96LB3 600 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM60Q9H2L4 133 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP14Q9HCL3 533 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PATJQ8NI35 1801 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 DCDC2BA2VCK2 349 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP11B2P19099 503 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 YARSP54577 528 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP2R5DQ14738 602 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 UPP1Q16831 310 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 C3orf58Q8NDZ4 430 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ERMNQ8TAM6 284 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4F11Q9HBI6 524 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF197O14709 1029 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT37O76014 449 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 CD300LGQ6UXG3 332 aa30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.4 ms