RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.24□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 ABI1Q8IZP0 508 aa9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 ZFP42Q96MM3 310 aa9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 GAD1Q99259 594 aa9.24□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 TRIM49CP0CI26 452 aa9.23□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 CGRRF1Q99675 332 aa9.23□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 GDF15Q99988 308 aa9.23□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 RBSNQ9H1K0 784 aa9.23□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.23□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.23□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.23□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.22□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 KCNE1P15382 129 aa9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 XKR4Q5GH76 650 aa9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.22□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 PLPP6Q8IY26 295 aa9.22□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.22□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 CASD1Q96PB1 797 aa9.22□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 PTPRJQ12913 1337 aa9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SGMS1-211ENST00000626236 INPPL1O15357 1258 aa9.21□□□□□ -0.94
SGMS1-211ENST00000626236 STX10O60499 249 aa9.21□□□□□ -0.94
SGMS1-211ENST00000626236 DGKIO75912 1065 aa9.21□□□□□ -0.94
SGMS1-211ENST00000626236 THP07101 528 aa9.21□□□□□ -0.94
SGMS1-211ENST00000626236 TPM2P07951 284 aa9.21□□□□□ -0.94
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.21□□□□□ -0.94
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