RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 STK25O00506 426 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 UBOX5O94941 541 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CALB1P05937 261 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 GOLGA8HP0CJ92 632 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CDC27P30260 824 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 LCORLQ8N3X6 602 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ANO3Q9BYT9 981 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 KDM6BO15054 1643 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ZBTB5O15062 677 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TSPAN9O75954 239 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TNFAIP8O95379 198 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PRR29P0C7W0 189 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 KRT17Q04695 432 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 GRM4Q14833 912 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ATL2Q8NHH9 583 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 FAF2Q96CS3 445 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 F8VZ95 297 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 AP3B1O00203 1094 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PRPSAP2O60256 369 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 RFC5P40937 340 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 MXI1P50539 228 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 MTTPP55157 894 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 C21orf59P57076 290 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 NR5A1Q13285 461 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 LRRC41Q15345 812 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SLC18A3Q16572 532 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF446Q9NWS9 450 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 MADDQ8WXG6 1647 aa7.24□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SMAPO00193 183 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PRAMEP78395 509 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SHC4Q6S5L8 630 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 KCTD6Q8NC69 237 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 INPP5DQ92835 1189 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ERP44Q9BS26 406 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PIK3R2O00459 728 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 LRRN2O75325 713 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 RPS6KA3P51812 740 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TUBA4AP68366 448 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 STXBP2Q15833 593 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 LONRF1Q17RB8 773 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CHP1Q99653 195 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 EURLQ9NYK6 297 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 COL15A1P39059 1388 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CRB1P82279 1406 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 P4HA2O15460 535 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ZBED1O96006 694 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CAPN1P07384 714 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PHKA2P46019 1235 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 C16orf72Q14CZ0 275 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TRADDQ15628 312 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SPDYCQ5MJ68 293 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.23□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms