RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-223ENST00000592576 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 ACRP10323 421 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 SYN1P17600 705 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM189BP81408 668 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 KCNMA1Q12791 1236 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 ZACNQ401N2 412 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 VSTM4Q8IW00 320 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 TAS1R2Q8TE23 839 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 KIF12Q96FN5 646 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 GCNT4Q9P109 453 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 CNTN3Q9P232 1028 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 APBA1Q02410 837 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 BIRC3Q13489 604 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 XKR4Q5GH76 650 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 GBP6Q6ZN66 633 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 CD302Q8IX05 232 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 DRC7Q8IY82 874 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 SPC24Q8NBT2 197 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 DPF3Q92784 378 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 BADQ92934 168 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 C2CD2Q9Y426 696 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 A0A1W2PQC6 194 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 ARL5CA6NH57 179 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 PTGESO14684 152 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC9A1P19634 815 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 IKBKEQ14164 716 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 TMC6Q7Z403 805 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 PGBD4Q96DM1 585 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 RSAD1Q9HA92 442 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 95.4
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-223ENST00000592576 TTC3P53804 2025 aa9.9□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PMM2O15305 246 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 P4HA2O15460 535 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 EOMESO95936 686 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PON1P27169 355 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 GUCY2FP51841 1108 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 AP3M2P53677 418 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CETN1Q12798 172 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 SEMA4DQ92854 862 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PHACTR2O75167 634 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 VNN1O95497 513 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 TNNC2P02585 160 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 FGFR1P11362 822 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ACTN1P12814 892 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 KCNE1P15382 129 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CDC25BP30305 580 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ZBTB6Q15916 424 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 EPC2Q52LR7 807 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.835e-7■■■□□ 19.2
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 FBXL13Q8NEE6 735 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 LMO3Q8TAP4 145 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 MIOSQ9NXC5 875 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 EPHB6O15197 1021 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 SCNN1GP51170 649 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 IL23AQ9NPF7 189 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 RAB20Q9NX57 234 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 DERAQ9Y315 318 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 HLA-DRAP01903 254 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 FPGSQ05932 587 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 NCOA4Q13772 614 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms