RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 SIX5Q8N196 739 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF558Q96NG5 402 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 POLD4Q9HCU8 107 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 MORC3Q14149 939 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 KIZQ2M2Z5 673 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 KSR1Q8IVT5 923 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 DZANK1Q9NVP4 752 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 SPG21Q9NZD8 308 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 DUSP12Q9UNI6 340 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A087WZ62 844 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC16A4O15374 487 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 DARSP14868 501 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF2BQ00403 316 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR182O15218 404 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R37O75864 691 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 GCNT3O95395 438 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 MAPK6Q16659 721 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 STRA6Q9BX79 667 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 GINS2Q9Y248 185 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 CHD6Q8TD26 2715 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 K7ERI5 159 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 STK4Q13043 487 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 STIM1Q13586 685 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM187BQ17R55 369 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 OTOP3Q7RTS5 596 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 CASD1Q96PB1 797 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 OSMRQ99650 979 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM206Q9H813 350 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 DACH1Q9UI36 760 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXA2O43364 376 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 PBX3P40426 434 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 NLRP12P59046 1061 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 MBTD1Q05BQ5 628 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 STRN3Q13033 797 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC43Q8N309 656 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 MLKLQ8NB16 471 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM40Q8WWA1 233 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 FZD8Q9H461 694 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNK12Q9HB15 430 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 CDHR5Q9HBB8 845 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 BIN1O00499 593 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 STK25O00506 426 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP4K3Q8IVH8 894 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 DCLK2Q8N568 766 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 HPS3Q969F9 1004 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 ACCSQ96QU6 501 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 ANO10Q9NW15 660 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 WNT16Q9UBV4 365 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 TBX20Q9UMR3 447 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 MYBP10242 640 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 STX1AQ16623 288 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R16BQ96T49 567 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 GDAQ9Y2T3 454 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR179Q6PRD1 2367 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-214ENST00000592483 ACKR2O00590 384 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 ERLIN2O94905 339 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CXCL14O95715 111 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKCBP05771 671 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC192P0DO97 292 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-214ENST00000592483 SDHBP21912 280 aa25.76■■□□□ 1.71
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