RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RSPH3Q86UC2 560 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TNS4Q8IZW8 715 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF169Q8NCN4 708 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LPPQ93052 612 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 HVCN1Q96D96 273 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 VWCEQ96DN2 955 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TSG101Q99816 390 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TCHPQ9BT92 498 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GBP3Q9H0R5 595 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 HIPK3Q9H422 1215 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.361e-21■■■■■ 79.2
CAPNS1-208ENST00000589162 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KLK14Q9P0G3 267 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TBX21Q9UL17 535 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PADI3Q9ULW8 664 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.58□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRJQ12913 1337 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 BICDL2A1A5D9 508 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SMTNL1A8MU46 457 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNJ18B7U540 433 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PDXKO00764 312 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOC3O60645 756 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRN2O75325 713 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGRP01833 764 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGB2P05107 769 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SELPP16109 830 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 AKAP5P24588 427 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KLK7P49862 253 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GATMP50440 423 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GUCY2FP51841 1108 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 EPHB4P54760 987 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 APBA1Q02410 837 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM9Q13443 819 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ALCAMQ13740 583 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNJ12Q14500 433 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 HOMEZQ8IX15 550 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 NME8Q8N427 588 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 DBF4BQ8NFT6 615 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXJ1Q92949 421 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 VPS16Q9H269 839 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM206Q9H813 350 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 INTS13Q9NVM9 706 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SNTG2Q9NY99 539 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.57□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ANK1P16157 1881 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LTBP2Q14767 1821 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0B4J269 797 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 H0YCG3 227 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 IKBKBO14920 756 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CETN3O15182 167 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX33O43247 280 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 EXTL3O43909 919 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM189A1O60320 539 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TOM1L1O75674 476 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF20AO95235 890 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCL8P10145 99 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CSF2RAP15509 400 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RAG1P15918 1043 aa6.56□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF18P17022 549 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms