RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 CITO14578 2027 aa28.1■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa28.1■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 CAND2O75155 1236 aa28.09■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 SCARA3Q6AZY7 606 aa28.09■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa28.09■■■□□ 2.09
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SCAMP4-210ENST00000588555 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
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SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.07■■■□□ 2.08
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SCAMP4-210ENST00000588555 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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