RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 FGFR4P22455 802 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 KRT71Q3SY84 523 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ACCSLQ4AC99 568 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 MOB2Q70IA6 237 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 PRELID2Q8N945 189 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 HAPLN2Q9GZV7 340 aa16.11■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 CCND2P30279 289 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 MAP3K10Q02779 954 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 FAM228AQ86W67 206 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 FBXL13Q8NEE6 735 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ATP8B4Q8TF62 1192 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 UPP2O95045 317 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ATP4AP20648 1035 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 RANBP1P43487 201 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 RAB27AP51159 221 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 NCKAP1LP55160 1127 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 KRT76Q01546 638 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 IFFO1Q0D2I5 559 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 CCDC38Q502W7 563 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 TREML2Q5T2D2 321 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 WDR78Q5VTH9 848 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD35Q8N283 1001 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 RASGEF1CQ8N431 466 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 NEK9Q8TD19 979 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 WHAMMQ8TF30 809 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 CCDC114Q96M63 670 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 SLC9A2Q9UBY0 812 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.1■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 UNCXA6NJT0 531 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ATP2C2O75185 946 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 BAG6P46379 1132 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 LIG4P49917 911 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 JAMLQ86YT9 394 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 CCDC13Q8IYE1 715 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 CCDC105Q8IYK2 499 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 NT5C1BQ96P26 610 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 CYP26B1Q9NR63 512 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 NCANO14594 1321 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 MAPTP10636 758 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 RRM1P23921 792 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 PSMC4P43686 418 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 CYP24A1Q07973 514 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ADCY1Q08828 1119 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 IFT88Q13099 833 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 NFIL3Q16649 462 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ASAP3Q8TDY4 903 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ANAPC7Q9UJX3 599 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 UBE4BO95155 1302 aa16.09■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 E7EVH7 732 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 COQ9O75208 318 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 STBD1O95210 358 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 MYZAPP0CAP1 466 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 PDE6CP51160 858 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 JAK3P52333 1124 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 MFAP3P55082 362 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 FMO2Q99518 471 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 FBXO40Q9UH90 709 aa16.08■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 GOLGA6L10A6NI86 522 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 H0YGN5 161 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PGK2P07205 417 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CD58P19256 250 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TNFRSF8P28908 595 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 LSP1P33241 339 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 RPL21P46778 160 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 C11orf70Q9BRQ4 267 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TCHPQ9BT92 498 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms