RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	NHLH1	Q02575	133 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	GPBP1	Q86WP2	473 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	KCNK12	Q9HB15	430 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM13A	O94988	1023 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	PROZ	P22891	400 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	ZPBP2	Q6X784	338 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	MYCT1	Q8N699	235 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	SNX27	Q96L92	541 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	32.27	■■■□□ 2.76	2e-6	■■□□□ 11.4
SMAD2-208	ENST00000587269	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	POLI	Q9UNA4	740 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SMAD2-208	ENST00000587269	XYLB	O75191	536 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	32.26	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	FGFR3	P22607	806 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	OR1D2	P34982	312 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	CUL4A	Q13619	759 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	IER5L	Q5T953	404 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	PODXL	O00592	558 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	C8A	P07357	584 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	KCNE1	P15382	129 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	XKR4	Q5GH76	650 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	SCP2	P22307	547 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	ARSH	Q5FYA8	562 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	CNTN3	Q9P232	1028 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	MTRR	Q9UBK8	725 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269		I3L4J1	428 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	FSHR	P23945	695 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	BRCC3	P46736	316 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	LIG4	P49917	911 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	RAB33A	Q14088	237 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	NXPE3	Q969Y0	559 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	REEP2	Q9BRK0	252 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	PARVG	Q9HBI0	331 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	CIT	O14578	2027 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	PLCG1	P19174	1290 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	NCKAP1L	P55160	1127 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	MCM6	Q14566	821 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	UVSSA	Q2YD98	709 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	PRSS33	Q8NF86	280 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	RAD54L	Q92698	747 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	MYADM	Q96S97	322 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269		K7ENM7	598 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	ADAM12	O43184	909 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	ELF1	P32519	619 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	MCL1	Q07820	350 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	KYAT1	Q16773	422 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	SEZ6	Q53EL9	994 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269		H7C4K7	107 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	ABLIM1	O14639	778 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	CCL16	O15467	120 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	PAPLN	O95428	1278 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	CLTA	P09496	248 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	RFX1	P22670	979 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	HOXA9	P31269	272 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	ABCD1	P33897	745 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	NUBP1	P53384	320 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	FLCN	Q8NFG4	579 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
SMAD2-208	ENST00000587269	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SMAD2-208	ENST00000587269	STK25	O00506	426 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SMAD2-208	ENST00000587269	LAMP2	P13473	410 aa		32.19	■■■□□ 2.74

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