RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 CHST7Q9NS84 486 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 STK17AQ9UEE5 414 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 DPP7Q9UHL4 492 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 TBX20Q9UMR3 447 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 CITO14578 2027 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
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PTPRM-214ENST00000583153 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
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PTPRM-214ENST00000583153 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
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PTPRM-214ENST00000583153 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.09□□□□□ -0.95
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PTPRM-214ENST00000583153 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.09□□□□□ -0.95
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PTPRM-214ENST00000583153 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.08□□□□□ -0.96
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PTPRM-214ENST00000583153 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.08□□□□□ -0.96
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PTPRM-214ENST00000583153 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
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PTPRM-214ENST00000583153 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.08□□□□□ -0.96
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PTPRM-214ENST00000583153 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRM-214ENST00000583153 I3L4J1 428 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRM-214ENST00000583153 PODXLO00592 558 aa9.07□□□□□ -0.96
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PTPRM-214ENST00000583153 TGM5O43548 720 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRM-214ENST00000583153 CUTAO60888 179 aa9.07□□□□□ -0.96
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PTPRM-214ENST00000583153 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRM-214ENST00000583153 ADALQ6DHV7 355 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRM-214ENST00000583153 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRM-214ENST00000583153 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRM-214ENST00000583153 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
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