RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM139Q8IV31 216 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTMR12Q9C0I1 747 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 IPPQ9Y573 584 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 CITO14578 2027 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 NRDCO43847 1150 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 JADE1Q6IE81 842 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 GJB7Q6PEY0 223 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM105AQ9NUU6 356 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 VNN1O95497 513 aa25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 NFICP08651 508 aa25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM191BP0C7N4 346 aa25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 RFX1P22670 979 aa25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 FECHP22830 423 aa25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM60Q495X7 471 aa25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 C2CD2Q9Y426 696 aa25.25■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRC53A6NM62 1247 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHACTR2O75167 634 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 RECQL4O94761 1208 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 HLA-DRAP01903 254 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 AKAP5P24588 427 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 TLE2Q04725 743 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAAP100Q0VG06 881 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 DSC3Q14574 896 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 IQCEQ6IPM2 695 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDXDC1Q6P996 788 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 NT5DC4Q86YG4 428 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNX27Q96L92 541 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNF39Q9H2S5 420 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 DNAJC12Q9UKB3 198 aa25.24■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 TNNC2P02585 160 aa25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 PIK3CAP42336 1068 aa25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 APOL6Q9BWW8 343 aa25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 NCOA4Q13772 614 aa25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM132DQ14C87 1099 aa25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 MEA1Q16626 185 aa25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR59Q6PJI9 974 aa25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPAG5Q96R06 1193 aa25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYO6Q9UM54 1294 aa25.23■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 MGEA5O60502 916 aa25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 JAM2P57087 298 aa25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAPGEF1Q13905 1077 aa25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 NT5C1BQ96P26 610 aa25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 STK33Q9BYT3 514 aa25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 CXCL16Q9H2A7 254 aa25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 CNTN3Q9P232 1028 aa25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 PARP2Q9UGN5 583 aa25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 DERAQ9Y315 318 aa25.22■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF623O75123 536 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 XKR4Q5GH76 650 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR44Q5JSH3 913 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADAM2Q99965 735 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 HIPK3Q9H422 1215 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A0U1RQF3 1178 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAB27AP51159 221 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPNMBQ14956 572 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 SFMBT2Q5VUG0 894 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 SCARA3Q6AZY7 606 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 HACE1Q8IYU2 909 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 HELQQ8TDG4 1101 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIF12Q96FN5 646 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 PYCARDQ9ULZ3 195 aa25.21■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIP11Q15643 1979 aa25.2■■□□□ 1.62
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARHGAP6O43182 974 aa25.2■■□□□ 1.62
RARA-AS1-201ENST00000581080 NBNO60934 754 aa25.2■■□□□ 1.62
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBTB6Q15916 424 aa25.2■■□□□ 1.62
RARA-AS1-201ENST00000581080 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.2■■□□□ 1.62
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