RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SPNS1-209ENST00000567771 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.89■■■□□ 2.06
SPNS1-209ENST00000567771 MFSD1Q9H3U5 465 aa27.89■■■□□ 2.06
SPNS1-209ENST00000567771 I3L4J1 428 aa27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 NARSO43776 548 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 HARSP12081 509 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 TKTP29401 623 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 OR1D2P34982 312 aa27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 BRCC3P46736 316 aa27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 LIN9Q5TKA1 542 aa27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 SNX27Q96L92 541 aa27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 ACAP3Q96P50 834 aa27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 C8AP07357 584 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 NUBP1P53384 320 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 SMTNP53814 917 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 STRN3Q13033 797 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 RAB33AQ14088 237 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 PPM1LQ5SGD2 360 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 FAM86C1Q9NVL1 165 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 MTRRQ9UBK8 725 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 LAMP2P13473 410 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 ARSHQ5FYA8 562 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 SLC44A3Q8N4M1 653 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 FLCNQ8NFG4 579 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 SLC38A7Q9NVC3 462 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 KCND2Q9NZV8 630 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 KCNG1Q9UIX4 513 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 FBXL21Q9UKT6 434 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 CDY1Q9Y6F8 540 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 DOCK8Q8NF50 2099 aa27.86■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 H0Y858 1186 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 PODXLO00592 558 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 TRAPPC3O43617 180 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 TOM1L1O75674 476 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 MAPTP10636 758 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 KCNE1P15382 129 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 NPR3P17342 541 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 NTHL1P78549 312 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 SEZ6Q53EL9 994 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 CNTN3Q9P232 1028 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 BACE2Q9Y5Z0 518 aa27.85■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 CCL16O15467 120 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 FSHRP23945 695 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 CLCN5P51795 746 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 ANKS3Q6ZW76 656 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 SLC7A14Q8TBB6 771 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 LRRC15Q8TF66 581 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 NXPE3Q969Y0 559 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 AK8Q96MA6 479 aa27.84■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 CFHP08603 1231 aa27.83■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 HOXA9P31269 272 aa27.83■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 GRIN1Q05586 938 aa27.83■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 ZPBP2Q6X784 338 aa27.83■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 SIX5Q8N196 739 aa27.83■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa27.83■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 POLIQ9UNA4 740 aa27.83■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 DOCK6Q96HP0 2047 aa27.83■■■□□ 2.05
SPNS1-209ENST00000567771 UBA7P41226 1012 aa27.82■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 NCKAP1LP55160 1127 aa27.82■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 SLC10A6Q3KNW5 377 aa27.82■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 MYH11P35749 1972 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 ANHXE9PGG2 379 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 SLC26A4O43511 780 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 PI15O43692 258 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 XYLBO75191 536 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 MCL1Q07820 350 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 HTR4Q13639 388 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 UVSSAQ2YD98 709 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 BRAPQ7Z569 592 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 GPBP1Q86WP2 473 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 CALML4Q96GE6 196 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 REEP2Q9BRK0 252 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 HAPLN2Q9GZV7 340 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 WNT16Q9UBV4 365 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 CACNA1HO95180 2353 aa27.81■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 CLDN3O15551 220 aa27.8■■■□□ 2.04
SPNS1-209ENST00000567771 AOC1P19801 751 aa27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.7 ms