RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561689.6

CLN3-209, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 2

Gene CLN3, Length 1,957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-209ENST00000561689 SURF1Q15526 300 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 LHX8Q68G74 356 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 NPTXRO95502 500 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 USP8P40818 1118 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 NCOA4Q13772 614 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 WDR44Q5JSH3 913 aa22.94■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 A0A087X0T9 212 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 LACTBL1A8MY62 500 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 B4GALT4O60513 344 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 AP3M2P53677 418 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 GNG11P61952 73 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 NOTUMQ6P988 496 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 SERINC5Q86VE9 423 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.93■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 IL18RAPO95256 599 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 SLC18A3Q16572 532 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 SESTD1Q86VW0 696 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 DNAI1Q9UI46 699 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 NFICP08651 508 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 CTSHP09668 335 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 ITGA7Q13683 1181 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 PTGISQ16647 500 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 ACAP3Q96P50 834 aa22.92■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 M0QZ92 97 aa22.91■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.91■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.91■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.9■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 FANCGO15287 622 aa22.9■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 GRM5P41594 1212 aa22.9■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 KIF18AQ8NI77 898 aa22.9■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.9■■□□□ 1.26
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CLN3-209ENST00000561689 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.89■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.89■■□□□ 1.26
CLN3-209ENST00000561689 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.253e-8■■■□□ 15.1
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CLN3-209ENST00000561689 TERF1P54274 439 aa22.89■■□□□ 1.25
CLN3-209ENST00000561689 KIF5AQ12840 1032 aa22.89■■□□□ 1.25
CLN3-209ENST00000561689 TRPC3Q13507 836 aa22.89■■□□□ 1.25
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