RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH19	Q9H159	772 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AKAP13-223	ENST00000560957	NRP1	O14786	923 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	AKAP10	O43572	662 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	APOL3	O95236	402 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	EYA4	O95677	639 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PFKM	P08237	780 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CBSL	P0DN79	551 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ATF3	P18847	181 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CBS	P35520	551 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB27A	P51159	221 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	GUCY2F	P51841	1108 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CD69	Q07108	199 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	DDB1	Q16531	1140 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL22	Q53GT1	634 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR78	Q5VTH9	848 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	DGKH	Q86XP1	1220 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB10	Q8WXI3	467 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM2	Q99965	735 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CHST12	Q9NRB3	414 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ING3	Q9NXR8	418 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MYPN	Q86TC9	1320 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LCHN	A4D1U4	455 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC119B	A6NIH7	251 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MARCH11	A6NNE9	402 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	GAS7	O60861	476 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH1A2	O94788	518 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	FSBP	O95073	299 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH8	O95206	1070 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LY86	O95711	162 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CD40	P25942	277 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	HTR3A	P46098	478 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT3A	P56704	352 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PHC1	P78364	1004 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TP53BP2	Q13625	1128 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC41	Q15345	812 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MAN2A1	Q16706	1144 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR158	Q5T848	1215 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PASD1	Q8IV76	773 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ATL2	Q8NHH9	583 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	RUNDC1	Q96C34	613 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	UIMC1	Q96RL1	719 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	MSRA	Q9UJ68	235 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	LEFTY2	O00292	366 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM38	O00635	465 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TBX3	O15119	743 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	BRINP1	O60477	761 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-DOA	P06340	250 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM27	P14373	513 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	RARRES1	P49788	294 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	NEK4	P51957	841 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNA2D1	P54289	1103 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AKAP13-223	ENST00000560957	OCA2	Q04671	838 aa		3.5	□□□□□ -1.85

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