RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560553.1

MFGE8-213, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 4

Gene MFGE8, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-213ENST00000560553 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 BRCC3P46736 316 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 MCM6Q14566 821 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 UPP1Q16831 310 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 ARSHQ5FYA8 562 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 SPECC1Q5M775 1068 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 IER5LQ5T953 404 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 LIN9Q5TKA1 542 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 GPR65Q8IYL9 337 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 FBXL6Q8N531 539 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 RAD54LQ92698 747 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 UROC1Q96N76 676 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 MYADMQ96S97 322 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 REEP2Q9BRK0 252 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 BACH2Q9BYV9 841 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 CLIC4Q9Y696 253 aa9.95□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 K7ENM7 598 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 CCL16O15467 120 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 CLDN3O15551 220 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 TOM1L1O75674 476 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 CXCL8P10145 99 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 SYT1P21579 422 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 FGFR3P22607 806 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 NCKAP1LP55160 1127 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 NHLH1Q02575 133 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 RESTQ13127 1097 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 XKR4Q5GH76 650 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 LILRA6Q6PI73 481 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 MYCT1Q8N699 235 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 PRSS33Q8NF86 280 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 STAMQ92783 540 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 PARVGQ9HBI0 331 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 KCND2Q9NZV8 630 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 CNTN3Q9P232 1028 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 POLIQ9UNA4 740 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.94□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 FRYLO94915 3013 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 SLC26A4O43511 780 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 TRAPPC3O43617 180 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 ZMYND10O75800 440 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 C8AP07357 584 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 KCNE1P15382 129 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 OR1D2P34982 312 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 LIG4P49917 911 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 NTHL1P78549 312 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 SPAG1Q07617 926 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 MCL1Q07820 350 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 PDXDC1Q6P996 788 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 ZPBP2Q6X784 338 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 USP49Q70CQ1 688 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 EPSTI1Q96J88 318 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 KCNK12Q9HB15 430 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 MTRRQ9UBK8 725 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-213ENST00000560553 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms