RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CIPC-208ENST00000557115 TOM1L1O75674 476 aa23.77■■□□□ 1.4
CIPC-208ENST00000557115 PROZP22891 400 aa23.77■■□□□ 1.4
CIPC-208ENST00000557115 OR1D2P34982 312 aa23.77■■□□□ 1.4
CIPC-208ENST00000557115 ALKAL1Q6UXT8 129 aa23.77■■□□□ 1.4
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CIPC-208ENST00000557115 SNX27Q96L92 541 aa23.77■■□□□ 1.4
CIPC-208ENST00000557115 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
CIPC-208ENST00000557115 POLIQ9UNA4 740 aa23.77■■□□□ 1.4
CIPC-208ENST00000557115 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 MYO10Q9HD67 2058 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 I3L4J1 428 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 PODXLO00592 558 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 ADAM12O43184 909 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 SLC26A4O43511 780 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 C8AP07357 584 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 FGFR3P22607 806 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 BRCC3P46736 316 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 XKR4Q5GH76 650 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 GPBP1Q86WP2 473 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 MYADMQ96S97 322 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 MTRRQ9UBK8 725 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 DUSP12Q9UNI6 340 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 NUB1Q9Y5A7 615 aa23.76■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 CLDN3O15551 220 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 XYLBO75191 536 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 KCNE1P15382 129 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 PDCP20941 246 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 TKTP29401 623 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 MRE11P49959 708 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 ZPBP2Q6X784 338 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 C3orf58Q8NDZ4 430 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 CNTN3Q9P232 1028 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 CDY1Q9Y6F8 540 aa23.75■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 ABLIM1O14639 778 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 CCL16O15467 120 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 FAM13AO94988 1023 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 PAPLNO95428 1278 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 FSHRP23945 695 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 RAB33AQ14088 237 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 SEZ6Q53EL9 994 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 ARSHQ5FYA8 562 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 MYCT1Q8N699 235 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 FLCNQ8NFG4 579 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 DENND4AQ7Z401 1863 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.74■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 LAMP2P13473 410 aa23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 PLCG1P19174 1290 aa23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 RPL9P32969 192 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 TCF15Q12870 199 aa23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 CD300LGQ6UXG3 332 aa23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 HAUS6Q7Z4H7 955 aa23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 NXPE3Q969Y0 559 aa23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 REEP2Q9BRK0 252 aa23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 WDFY4Q6ZS81 3184 aa23.73■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 HOXA9P31269 272 aa23.72■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 LIG4P49917 911 aa23.72■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 NUBP1P53384 320 aa23.72■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 NCKAP1LP55160 1127 aa23.72■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 MCL1Q07820 350 aa23.72■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 CUL4AQ13619 759 aa23.72■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 MCM6Q14566 821 aa23.72■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 UVSSAQ2YD98 709 aa23.72■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa23.72■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 K7ENM7 598 aa23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 STK25O00506 426 aa23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 NARSO43776 548 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 CFHP08603 1231 aa23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 NTHL1P78549 312 aa23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 GRIN1Q05586 938 aa23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 SIX5Q8N196 739 aa23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 PARVGQ9HBI0 331 aa23.71■■□□□ 1.39
CIPC-208ENST00000557115 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CIPC-208ENST00000557115 CXCL8P10145 99 aa23.7■■□□□ 1.38
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