RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CXCL8P10145 99 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ITGA4P13612 1032 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RFX1P22670 979 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PON1P27169 355 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BMP8BP34820 402 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MBTPS1Q14703 1052 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZACNQ401N2 412 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CBWD6Q4V339 395 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CBWD3Q5JTY5 395 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SV2AQ7L0J3 742 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CNGA4Q8IV77 575 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM192Q8IY95 271 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF516Q92618 1163 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GDF15Q99988 308 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMX1Q9H3N1 280 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RAB20Q9NX57 234 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GCNT4Q9P109 453 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PARP2Q9UGN5 583 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRIP11Q15643 1979 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KIAA0355O15063 1070 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NRDCO43847 1150 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NBNO60934 754 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RECQL4O94761 1208 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TIMP1P01033 207 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RAG1P15918 1043 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC9A1P19634 815 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CYP3A5P20815 502 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CYP2C18P33260 490 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCL23P55773 120 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM189BP81408 668 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BIRC3Q13489 604 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRPC3Q13507 836 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EPC2Q52LR7 807 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 XKR4Q5GH76 650 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WDR44Q5JSH3 913 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC186Q7Z3E2 898 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM199Q8N511 208 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TAF4BQ92750 862 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SNX27Q96L92 541 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CRACR2AQ9BSW2 395 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CEP72Q9P209 647 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CNTN3Q9P232 1028 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HES2Q9Y543 173 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C9IYK1 514 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ENPP3O14638 875 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MGEA5O60502 916 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GYPCP04921 128 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PFKMP08237 780 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KCNE1P15382 129 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AKAP5P24588 427 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ATICP31939 592 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CASP14P31944 242 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PIK3CAP42336 1068 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KLK7P49862 253 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WNT7BP56706 349 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZBED6P86452 979 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GPNMBQ14956 572 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZBTB6Q15916 424 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PTPN21Q16825 1174 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HS1BP3Q53T59 392 aa9.11□□□□□ -0.95
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms