RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 STK3Q13188 491 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 EMC4Q5J8M3 183 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 ADALQ6DHV7 355 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 SPRED2Q7Z698 418 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 KRT222Q8N1A0 295 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 FBXL16Q8N461 479 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 C7orf31Q8N865 590 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 FSIP1Q8NA03 581 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 NETO2Q8NC67 525 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 HIPK4Q8NE63 616 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 LMBR1Q8WVP7 490 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 PEX11GQ96HA9 241 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 MYD88Q99836 296 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 PLCD4Q9BRC7 762 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 SDF4Q9BRK5 362 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 ANO3Q9BYT9 981 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 C19orf44Q9H6X5 657 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 ZMAT4Q9H898 229 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 ASH2LQ9UBL3 628 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 ABCC6O95255 1503 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 WDR19Q8NEZ3 1342 aa4.91□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 SPEF2Q9C093 1822 aa4.9□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
USP25-210ENST00000549362 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CCDC69A6NI79 296 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 FAM90A27PA6NNH2 459 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 VSTM5A8MXK1 200 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 F8W031 263 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 NFIBO00712 420 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CPLX1O14810 134 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 IKBKBO14920 756 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ZSCAN12O43309 604 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 GCP02774 474 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CYP21A2P08686 494 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 TMEM253P0C7T8 217 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 GPR3P46089 330 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 FNTBP49356 437 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 TUBB4BP68371 445 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 TRDNQ13061 729 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 GTF2H3Q13889 308 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ODF1Q14990 250 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 IQCB1Q15051 598 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 BRD3Q15059 726 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 PDCD1Q15116 288 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 STK38Q15208 465 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 EPHA7Q15375 998 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 SEC23AQ15436 765 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 UGT8Q16880 541 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CT83Q5H943 113 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CCDC158Q5M9N0 1113 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 TMEM240Q5SV17 173 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 TEX35Q5T0J7 233 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ZNF790Q6PG37 636 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 OLFM4Q6UX06 510 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 IFNL2Q8IZJ0 200 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 MYLIPQ8WY64 445 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 FERMT2Q96AC1 680 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 E2F7Q96AV8 911 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 BORCS6Q96GS4 357 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 C8orf76Q96K31 380 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 TIGD1Q96MW7 591 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 SIL1Q9H173 461 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 PAG1Q9NWQ8 432 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ABCC12Q96J65 1359 aa4.9□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa4.89□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms