RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.37■□□□□ 0.85
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PUF60-218ENST00000531995 MYO10Q9HD67 2058 aa20.37■□□□□ 0.85
PUF60-218ENST00000531995 MYL1P05976 194 aa20.36■□□□□ 0.85
PUF60-218ENST00000531995 PROZP22891 400 aa20.36■□□□□ 0.85
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PUF60-218ENST00000531995 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PUF60-218ENST00000531995 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PUF60-218ENST00000531995 PGBD4Q96DM1 585 aa20.36■□□□□ 0.85
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PUF60-218ENST00000531995 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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PUF60-218ENST00000531995 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.36■□□□□ 0.85
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PUF60-218ENST00000531995 SPATA20Q8TB22 786 aa20.34■□□□□ 0.85
PUF60-218ENST00000531995 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PUF60-218ENST00000531995 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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PUF60-218ENST00000531995 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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PUF60-218ENST00000531995 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.32■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 HVCN1Q96D96 273 aa20.32■□□□□ 0.84
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PUF60-218ENST00000531995 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.32■□□□□ 0.84
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PUF60-218ENST00000531995 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.31■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.31■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 CFAP54Q96N23 3096 aa20.31■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 F8W810 466 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 NRP1O14786 923 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 KINO60870 393 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 URODP06132 367 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ITGA4P13612 1032 aa20.3■□□□□ 0.84
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PUF60-218ENST00000531995 ADSSP30520 456 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-218ENST00000531995 ABCD1P33897 745 aa20.3■□□□□ 0.84
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