RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 GTF2H1P32780 548 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 ITGA8P53708 1063 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 CYP24A1Q07973 514 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 USP37Q86T82 979 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 CEP57Q86XR8 500 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 MCOLN2Q8IZK6 566 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF341Q9BYN7 854 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP2-221ENST00000511747 WDR64B1ANS9 1081 aa28.89■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 RAD17O75943 681 aa28.89■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 RRM1P23921 792 aa28.89■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 CPA5Q8WXQ8 436 aa28.89■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa28.89■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 MROH7Q68CQ1 1323 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 ASNSP08243 561 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 RPS6P62753 249 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 GHRHRQ02643 423 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 GCNT1Q02742 428 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 PTK6Q13882 451 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 PGM5Q15124 567 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 VSTM1Q6UX27 236 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 MAGEC3Q8TD91 643 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 MAIP1Q8WWC4 291 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM81BQ96LP2 452 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 GAS8O95995 478 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 JAK3P52333 1124 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 SOX10P56693 466 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 BSNDQ8WZ55 320 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 ABCF3Q9NUQ8 709 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXO6A8MYZ6 492 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 TCP11X1B4DZS4 312 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 MAN1A1P33908 653 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 ADCY8P40145 1251 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 C2CD6Q53TS8 623 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 WLSQ5T9L3 541 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM84AQ96KN4 292 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 DCLK3Q9C098 648 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 APBA3O96018 575 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP5DP30049 168 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC1A1P43005 524 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 ATL2Q8NHH9 583 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 GRK7Q8WTQ7 553 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAIPQ9BWF2 469 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNK9Q9NPC2 374 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 SFNP31947 248 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 GPATCH11Q8N954 259 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 ANAPC5Q9UJX4 755 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 THAP12O43422 761 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 LLGL2Q6P1M3 1020 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC63Q8NA47 563 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 PWWP2AQ96N64 755 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 GMLQ99445 158 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 HEMGNQ9BXL5 484 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 MLXIPLQ9NP71 852 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 MYPNQ86TC9 1320 aa28.85■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 OAS1P00973 400 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 ATF2P15336 505 aa28.85■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 VPS41P49754 854 aa28.85■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 RMDN3Q96TC7 470 aa28.85■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa28.85■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 C21orf2O43822 256 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 KRT76Q01546 638 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 CAV1Q03135 178 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 NUGGCQ68CJ6 796 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 GPD1LQ8N335 351 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 SPIRE2Q8WWL2 714 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM213AQ9BRX8 229 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 GGT7Q9UJ14 662 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 MPP2Q14168 576 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD42Q8N9B4 389 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 MYBL1P10243 752 aa28.83■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 RALAP11233 206 aa28.83■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf112Q9NSG2 853 aa28.83■■■□□ 2.21
SH3BP2-221ENST00000511747 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms