RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 A0A1B0GTW7 788 aa5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 TEX33O43247 280 aa5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 FDXRP22570 491 aa5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 GUCY1A2P33402 732 aa5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 ALDH1A3P47895 512 aa5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 OCA2Q04671 838 aa5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 INSL6Q9Y581 213 aa5.69□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 WNT10BO00744 389 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 PRKD3O94806 890 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 ELANEP08246 267 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 TYRP1P17643 537 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 FPR1P21462 350 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 FGFR4P22455 802 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 GPR3P46089 330 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 MGAT2Q10469 447 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 FOXI1Q12951 378 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 DNM3Q9UQ16 869 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 GPR39O43194 453 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 GPR32O75388 356 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 EYA4O95677 639 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 ESRRBO95718 433 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 GPANK1O95872 356 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 ALAS1P13196 640 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 FBLP22087 321 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 GCSHP23434 173 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 PLA2G5P39877 138 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 MTNR1BP49286 362 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 CXADRP78310 365 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 HSD11B2P80365 405 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 AMOTL1Q8IY63 956 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 ATL2Q8NHH9 583 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 COG1Q8WTW3 980 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 SLC9A6Q92581 669 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 VOPP1Q96AW1 172 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 RSAD1Q9HA92 442 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 MASP2O00187 686 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 ERN1O75460 977 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 SLC6A2P23975 617 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC142Q17RM4 750 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 PRR16Q569H4 304 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 GPR149Q86SP6 731 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.59e-7■□□□□ 10
UBE2B-202ENST00000499038 Q96MF0 132 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 MYOCQ99972 504 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 CASS4Q9NQ75 786 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 USP25Q9UHP3 1055 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.66□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 CD38P28907 300 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 PCSK1P29120 753 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 SLC6A9P48067 706 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 CREMQ03060 361 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 SCAPQ12770 1279 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 SEPT2Q15019 361 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 CLUL1Q15846 466 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 ATP2B3Q16720 1220 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 CAGE1Q8TC20 777 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 BOD1Q96IK1 185 aa5.65□□□□□ -1.5
UBE2B-202ENST00000499038 MAST3O60307 1309 aa5.65□□□□□ -1.51
UBE2B-202ENST00000499038 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-202ENST00000499038 VIL1P09327 827 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-202ENST00000499038 CKBP12277 381 aa5.64□□□□□ -1.51
UBE2B-202ENST00000499038 FBXO42Q6P3S6 717 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms