RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 ZNF131P52739 623 aa24.79■■□□□ 1.56
SENP6-211ENST00000493959 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SENP6-211ENST00000493959 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.79■■□□□ 1.56
SENP6-211ENST00000493959 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SENP6-211ENST00000493959 FIZ1Q96SL8 496 aa24.79■■□□□ 1.56
SENP6-211ENST00000493959 PANK2Q9BZ23 570 aa24.79■■□□□ 1.56
SENP6-211ENST00000493959 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.79■■□□□ 1.56
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SENP6-211ENST00000493959 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
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SENP6-211ENST00000493959 TBX20Q9UMR3 447 aa24.78■■□□□ 1.56
SENP6-211ENST00000493959 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.77■■□□□ 1.56
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SENP6-211ENST00000493959 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
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SENP6-211ENST00000493959 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP6-211ENST00000493959 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SENP6-211ENST00000493959 BICD1Q96G01 975 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP6-211ENST00000493959 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.77■■□□□ 1.56
SENP6-211ENST00000493959 CNTN3Q9P232 1028 aa24.77■■□□□ 1.56
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SENP6-211ENST00000493959 K7ENM7 598 aa24.76■■□□□ 1.55
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SENP6-211ENST00000493959 SLC38A7Q9NVC3 462 aa24.75■■□□□ 1.55
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SENP6-211ENST00000493959 A0A087X0B3 334 aa24.74■■□□□ 1.55
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SENP6-211ENST00000493959 LIG4P49917 911 aa24.74■■□□□ 1.55
SENP6-211ENST00000493959 CREMQ03060 361 aa24.74■■□□□ 1.55
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SENP6-211ENST00000493959 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.73■■□□□ 1.55
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SENP6-211ENST00000493959 FAM189A1O60320 539 aa24.72■■□□□ 1.55
SENP6-211ENST00000493959 PAPLNO95428 1278 aa24.72■■□□□ 1.55
SENP6-211ENST00000493959 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SENP6-211ENST00000493959 PIGRP01833 764 aa24.72■■□□□ 1.55
SENP6-211ENST00000493959 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SENP6-211ENST00000493959 GTF2BQ00403 316 aa24.72■■□□□ 1.55
SENP6-211ENST00000493959 RAB33AQ14088 237 aa24.72■■□□□ 1.55
SENP6-211ENST00000493959 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa24.72■■□□□ 1.55
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