RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493208.1

IRF1-210, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IRF1, Length 1,023 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-210ENST00000493208 KCNE1P15382 129 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 PLCG1P19174 1290 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 PROZP22891 400 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 HOXA9P31269 272 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 NCKAP1LP55160 1127 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 OSTNP61366 133 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 MCL1Q07820 350 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 MAPK7Q13164 816 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 UPP1Q16831 310 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 SV2BQ7L1I2 683 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 KCNK18Q7Z418 384 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 HASPINQ8TF76 798 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 HVCN1Q96D96 273 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 SNX27Q96L92 541 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 REEP2Q9BRK0 252 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 POLD4Q9HCU8 107 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 CNTN3Q9P232 1028 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
IRF1-210ENST00000493208 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 PODXLO00592 558 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 ZMYND10O75800 440 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 GAP43P17677 238 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 CLCNKBP51801 687 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 ALCAMQ13740 583 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 POSTNQ15063 836 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 STK38Q15208 465 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 XKR4Q5GH76 650 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 MAFFQ9ULX9 164 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 TBX20Q9UMR3 447 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 CLUHO75153 1309 aa14.83□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 FGFR3P22607 806 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 RFX1P22670 979 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 MCM4P33991 863 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 ZNF131P52739 623 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 AMPD3Q01432 767 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 RTP2Q5QGT7 225 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 ELMOD1Q8N336 334 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 FBXL6Q8N531 539 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 SNX21Q969T3 373 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.82□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 OGTO15294 1046 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 C8AP07357 584 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 POU2F2P09086 479 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 WEE2P0C1S8 567 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 CYP3A5P20815 502 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 STAT6P42226 847 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 TDGQ13569 410 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 RAB33AQ14088 237 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 MCM6Q14566 821 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 NAB2Q15742 525 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 ZNF280DQ6N043 979 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 USP37Q86T82 979 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 BEST2Q8NFU1 509 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 RABGGTAQ92696 567 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 CUEDC2Q9H467 287 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 MTRRQ9UBK8 725 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 USP20Q9Y2K6 914 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.81□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 PRRG1O14668 218 aa14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 PIGRP01833 764 aa14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 LRG1P02750 347 aa14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 EDN1P05305 212 aa14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 OR1D2P34982 312 aa14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 PTPN5P54829 565 aa14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 GTF2BQ00403 316 aa14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 RESTQ13127 1097 aa14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 SLC39A14Q15043 492 aa14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 ARSHQ5FYA8 562 aa14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 ATL3Q6DD88 541 aa14.8□□□□□ -0.04
IRF1-210ENST00000493208 LILRA6Q6PI73 481 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms