RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489994.5

IFRD1-215, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IFRD1, Length 1,721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-215ENST00000489994 DZANK1Q9NVP4 752 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 TMX2Q9Y320 296 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SAMM50Q9Y512 469 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 NRXN2Q9P2S2 1712 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 INSRP06213 1382 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CEP290O15078 2479 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SCN11AQ9UI33 1791 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 MYPNQ86TC9 1320 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 MSTNO14793 375 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 NVLO15381 856 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 EXTL3O43909 919 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 B4GALT4O60513 344 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CAPNS1P04632 268 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ATP6V1B1P15313 513 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ITPKAP23677 461 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ANXA13P27216 316 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 GALNSP34059 522 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CETN2P41208 172 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 TUFMP49411 452 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 RENBPP51606 427 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 PLTPP55058 493 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SLC14A2Q15849 920 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CCDC153Q494R4 210 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ANKDD1AQ495B1 522 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CEP78Q5JTW2 689 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CFAP157Q5JU67 520 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 IL31Q6EBC2 164 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CCDC121Q6ZUS5 278 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 IKBIPQ70UQ0 350 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 C7orf61Q8IZ16 206 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 FBXO27Q8NI29 283 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ASAP3Q8TDY4 903 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 LPIN2Q92539 896 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SPDL1Q96EA4 605 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 LRRC3Q9BY71 257 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 EDEM3Q9BZQ6 932 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 RNF181Q9P0P0 153 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ZNF148Q9UQR1 794 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CCDC171Q6TFL3 1326 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 A0A096LPE4 126 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 A0A0A0MRY4 1105 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 A0A1W2PPZ6 126 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CCDC169A6NNP5 214 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 METTL12A8MUP2 240 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 C9IYK1 514 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 PI4K2BG5E9Z4 385 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SULT1B1O43704 296 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 STX6O43752 255 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 PAGE1O75459 146 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 USP2O75604 605 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ERLIN2O94905 339 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 TGDSO95455 350 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ALAS1P13196 640 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ACTN2P35609 894 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 ETV1P50549 477 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 UBXN1Q04323 297 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CETN1Q12798 172 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 PRKG2Q13237 762 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 MTX1Q13505 466 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 RASGRF1Q13972 1273 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 SEPT6Q14141 434 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 MPP2Q14168 576 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 GRIK5Q16478 980 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CCNG2Q16589 344 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 CCDC38Q502W7 563 aa5.94□□□□□ -1.46
IFRD1-215ENST00000489994 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms