RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TNFSF13BQ9Y275 285 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 USP20Q9Y2K6 914 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC66A2RUB6 948 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 CA3P07451 260 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 FGFR1P11362 822 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 RABGGTBP53611 331 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 GIT2Q14161 759 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TTC30AQ86WT1 665 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 DEFB123Q8N688 67 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TULP2O00295 520 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 ITGB3P05106 788 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 GARTP22102 1010 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TUSC3Q13454 348 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 HPS3Q969F9 1004 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 ASB7Q9H672 318 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 ERICH4A6NGS2 130 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 THAP12O43422 761 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 RGS20O76081 388 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 MYL4P12829 197 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 GLUD2P49448 558 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 GRIN1Q05586 938 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 NCOA4Q13772 614 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 UVSSAQ2YD98 709 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.823e-7■■■□□ 15.3
DDX39B-215ENST00000462256 IPPQ9Y573 584 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 SQORQ9Y6N5 450 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 PDE6CP51160 858 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 FAAP100Q0VG06 881 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 KCNB1Q14721 858 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 ITIH5Q86UX2 942 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 RABGGTAQ92696 567 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 UROC1Q96N76 676 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TCF25Q9BQ70 676 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 RNF19AQ9NV58 838 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 KCNJ18B7U540 433 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 PODXLO00592 558 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 GJC1P36383 396 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 KCNJ12Q14500 433 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 SHHQ15465 462 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 STKLD1Q8NE28 680 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 WDR70Q9NW82 654 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 COX16Q9P0S2 106 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 UBE4BO95155 1302 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 LAMB2P55268 1798 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 KIAA0355O15063 1070 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 COL6A1P12109 1028 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 LPIN1Q14693 890 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 SPATA1Q5VX52 437 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 FBXL13Q8NEE6 735 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TAF4BQ92750 862 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 ENPP3O14638 875 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 CKMP06732 381 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 RALAP11233 206 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 ADORA2BP29275 332 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 CDR1P51861 262 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 AMPD2Q01433 879 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TMC6Q7Z403 805 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 KAT2BQ92831 832 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC42Q96M95 316 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 B4GALT5O43286 388 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TRIM49P0CI25 452 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 TRIM49CP0CI26 452 aa9.93□□□□□ -0.82
DDX39B-215ENST00000462256 AVPR1AP37288 418 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms